原文:ComplexHeatmap|根據excel表繪制突變景觀圖(oncoplot)

本文首發於 生信補給站 :https: mp.weixin.qq.com s kz oKvUQrCR HWYXQT g 如果有maf格式的文件,可以直接oncoplot包繪制瀑布圖,有多種展示和統計maftools 從頭開始繪制發表級oncoplot 瀑布圖 和maftools TCGA腫瘤突變數據的匯總,分析和可視化,如果只有多個樣本的基因突變與否的excel,不用擔心,也可以用complex ...

2020-06-17 18:51 0 896 推薦指數:

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ComplexHeatmap 繪制腫瘤突變分布

來源:https://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/ 安裝 7.2 Apply to cBioPortal dataset 通過使用實際數據展示oncoPring()的優勢。數據來源於cBioPortal。執行步驟 ...

Wed Sep 11 18:36:00 CST 2019 1 2164
使用GenVisR包進行驅動突變的熱繪制

使用GenVisR包進行驅動突變的熱繪制 介紹 通過熱顯示突變的整體情況 代碼講解 加載包,讀入數據 它的輸入數據’drivers_lung.txt’部分如下 代碼如下 這里用GenVisR包的waterfall函數進行突變的瀑布繪制 ...

Fri Nov 13 06:44:00 CST 2020 0 446
complexHeatmap包畫分類熱

用途:一般我們畫熱是以連續變量作為填充因子,complexHeatmap的oncopoint函數可以以類別變量作為填充因子作熱。 用法:oncoPrint(mat, get_type = function(x) x,alter_fun = alter_fun_list ...

Wed Nov 08 23:10:00 CST 2017 0 2473
Excel繪制Q-Q

Q-Q可以用於檢驗樣本是否服從正態分布,在Excel繪制Q-Q步驟如下(參考How do you make Q-Q plot in Excel?): 排序的數據集 A sorted data set 對數據點排序的序數序列 An ordinal sequence to rank ...

Fri May 29 06:48:00 CST 2020 0 2583
Python Excel 繪制柱形

本文主要講述如何使用Python操作Excel繪制柱形。 相關代碼請參考 https://github.com/RustFisher/python-playground 本文鏈接:https://www.rustfisher.com/2019/11/19/Python ...

Wed Nov 20 06:07:00 CST 2019 0 2185
Python openpyxl Excel繪制柱形

這是一份openpyxl的使用指南。 大體內容翻譯自官網 https://openpyxl.readthedocs.io/en/stable/charts/bar.html#vertical-hor ...

Fri Nov 15 06:08:00 CST 2019 0 1120
3D園林景觀效果制作步驟

城市打造園林景觀能夠給市民帶來更加優美的環境,也能在煩躁的城市里有一處可以休息的寧靜之地,讓人們感到更加幸福。園林景觀要制作好,可能需要盡管多番的討論,在設計階段就需要先做一個效果出來讓大家能看到做出來的園林景觀直接效果,進而參與討論。現在園林景觀大多是用3d的方式呈現,那么3D ...

Wed Feb 15 19:34:00 CST 2017 0 2247
 
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