原文:Linux 生信項目案例在線分析

本文轉自https: freeaihub.com article bioinformatics in linux.html,該頁可在線進行操作。 Linux對生物信息的學習和實踐有強大的輔助作用,不管自己編寫shell命令腳本處理數據,還是使用現有豐富生物信息分析工具。Linux強大命令行功能,可以快速 批量 靈活的處理數據的提取 統計和整理等耗時耗力的重復性工作。日常生信分析中,多數整理工作都是 ...

2020-06-09 09:18 0 728 推薦指數:

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常用分析軟件

官網 源碼 安裝&使用 BWA http://bio-bwa.sourceforge.net/ ht ...

Sat Nov 03 06:05:00 CST 2018 0 906
部署一個簡單的分析流程

在生公司里,有相當一部分人都是負責編寫流程和維護流程。 流程pipeline,就是讓用戶(前端)在填寫配置文件后能夠一鍵運行的腳本,最終自動得出結果,並生成報告,有的公司還會將結果上傳。 自動化pipeline必須具備的功能: 讀取配置文件,生成相應的待執行的腳本 按照先后 ...

Tue Nov 29 00:03:00 CST 2016 0 3608
案例分析——快手百萬在線直播

一、前言 首先分享出原文鏈接 http://www.infoq.com/cn/news/2017/09/streaming-Pipeline-kuaishou。自己平時並未用過 ...

Fri Sep 15 06:05:00 CST 2017 0 1560
實驗四 軟件項目案例分析

實驗四 軟件項目案例分析 2020-4-2 Deadline:2020-4-11 10:00,以博客發表日期為准 評分標准: 按時交 - 有分(滿分100分),檢查項目包括: 任務1部分(32分) 任務2部分(10分) 任務3部分(46分) 任務4部分(12分 ...

Thu Apr 02 06:10:00 CST 2020 0 2058
分析-windows-blast序列比對

這是一個嘗試性的文章,能不能解決我要解決的問題,並不清楚。 ===本文利用NCBI的blast界面,實現將短序列比對上reference基因組,並實現變異位點可視化。===補言=== 比對常用的是 ...

Thu Dec 03 02:28:00 CST 2020 0 487
基礎知識【04】GO和pathway分析

非原創 參考資料: 一文掌握GO和pathway分析 - 生物信息學討論版 -丁香園論壇http://www.dxy.cn/bbs/thread/34904124#34904124 GO富集 GO是Gene ontology的縮寫,GO數據庫分別從功能、參與的生物途徑及細胞 ...

Fri Jun 22 19:59:00 CST 2018 0 16287
 
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