PCA 主成分分析實踐 plink軟件
。 2、運行plink軟件，命令如下： plink --file test --sheep --pca 5 h ...
原文：plink 進行PCA分析
當我們進行群體遺傳分析時，得到vcf后，可利用plink進行主成分 PCA 分析 一 軟件安裝 二 使用流程 第一步：將vcf轉換為plink格式 上述會得到.map, .nosex和.ped結尾的三個文件。 第二步：基於.ped生成一個bed文件 二進制文件 上述得到.bim, .bed 結尾的兩個文件 第三步：PCA分析 上述得到.eigenval 和.eigenvec 結尾的兩個文件，其中. ...
2020-04-26 14:00 0 3506 推薦指數：
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