蛋白質序列位置特異性矩陣(PSSM)的獲取
一、下載安裝ncbi-blast（一定要是最新版本，在這里吃了苦頭） 下載地址：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATES ...
原文：蛋白質序列位置特異性矩陣(PSSM)的獲取的准備工作：fasta序列的處理
由於獲取位置特異性矩陣需要使用psiblast db swissprot query .txt evalue . num iterations out ascii pssm .pssm命令獲取，然而該命令只對一個序列比對，如果把大量蛋白質序列輸入，其結果會不斷更新，最后得到最后那個序列的位置特異性矩陣，所以，需要對於蛋白質序列進行分割成多個文件 代碼如下： 這里每個人蛋白質序列所用的長度不同，可根 ...
2020-04-25 21:49 0 746 推薦指數：
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