GWAS: 曼哈頓圖，QQ plot 圖，膨脹系數（ manhattan、Genomic Inflation Factor）
畫曼哈頓圖和QQ plot 首推R包“qqman”，簡約方便。下面具體介紹以下。 一、畫曼哈頓圖 install.packages("qqman") library(qqman) 1、准備包含SNP, CHR, BP, P的文件gwasResults ...
原文：使用qqman對曼哈頓圖（Manhattan plot ）多個顯著位點標志不同顏色，拒絕屎一樣的綠色
歡迎來到 bio生物信息 的世界 之前的推文GWAS: 曼哈頓圖，QQ plot 圖，膨脹系數 manhattan Genomic Inflation Factor 寫過如何用qqman包做曼哈頓圖。 但眾所周知 據我說知 ，這個包畫圖很丑，尤其想highlight顯著位點時，屎一樣的綠色讓人一言難盡。 這話不是我說是，是下面這位小伙子說的 此外，該包還有一個明顯缺點，只能highlight一個顯 ...
2020-04-17 23:06 0 2094 推薦指數：
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