GTEx數據庫
GTEx database：該數據庫是健康人貢獻的組織的RNASeq的數據。還有snp信息。將snp信息與gene的表達水平結合起來。 donor： donor貢獻的tissue。 gene表達水平（用FPKM表示gene的表達水平）受其周圍snp的影響，這樣的gene ...
原文：基於MatrixEQTL進行eQTL mapping analysis——以GTEx數據庫為例
MatrixEQTL是一個快速有效的cis trans eQTL mapping分析工具，被The Genotype Tissue Expression GTEx 數據庫用於eQTL mapping分析。使用MatrixEQTL進行eQTL mapping需要五個輸入文件，即SNP.txt snpmatrix文件，行名為樣本名稱，列名為snpid ， GE.txt 基因表達量文件，行名為樣本名稱， ...
2020-04-12 22:49 0 1868 推薦指數：
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首先QTL是數量性狀位點，比如身高是一個數量性狀，其對應的控制基因的位點就是一個數量性狀位點，而eQTL就是控制數量性狀表達位點，即能控制數量性狀基因（如身高基因）表達水平高低的那些基因的位點。 數量性狀基因座：控制數量性狀的基因在基因組中的位置稱數量性狀基因座。常利用DNA分子標記技術對這些區域 ...
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