2023年05月02日 還好沒有走上純生信的灌水之路,要扎扎實實的搞干濕結合,只有問題問好了、實驗設計好了、數據測好了,生信才能迸發出高能的威力! TCGA數據下載 基本的TPM表達數據 全網最全!TCGA新版數據下載與整理教程來了!來抄作業! 單基因泛癌|CCLE數據下載 ...
轉自生信菜鳥團,如有侵權j,請聯系微信:biozhangz進行刪除. GTEx數據庫 TCGA數據挖掘的好幫手 Posted on 年 月 日 通常我們在挖掘TCGA數據庫的時候,會發現該項目納入的正常組織測序結果是非常少的,也就是說很多病人都不會有他的正常組織的轉錄組測序結果,比如說乳腺癌吧, 個左右的轉錄組數據,其中 左右都是腫瘤組織的測序數據,只有區區 個左右的正常對照。 這個時候我們就需要 ...
2020-04-11 18:45 0 1861 推薦指數:
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摘要:pagehack和pg_xlogdump可以幫助我們在數據庫故障定位中,解析各種文件的頁面頭和xlog日志。 隨着技術的演進,數據也發生了巨大的變化,數據規模越來愈大、數據種類呈現多樣性,數據處理的時效性要求也越來越高,GaussDB(DWS)實時數倉當前面臨着巨大的機遇 ...
GTEx database:該數據庫是健康人貢獻的組織的RNASeq的數據。還有snp信息。將snp信息與gene的表達水平結合起來。 donor: donor貢獻的tissue。 gene表達水平(用FPKM表示gene的表達水平)受其周圍snp的影響,這樣的gene ...
問題: 什么是免疫細胞浸潤? 腫瘤組織里都有哪些細胞?有哪些免疫細胞? 免疫細胞浸潤分析的基本原理?相關性 bulk RNA-seq拆分scRNA-seq的原理 免疫浸潤評估常 ...
對於電商來說,銷售額就是生命線,業務運營人員需要實時關注訂單量,交易額,支付轉化率等,並從各種維度對比分析,無論增幅或降幅,都需要馬上找到原因,落地運營手段進行干預。快速准確的得到各種營銷數據就顯得格外重要,這就對數據的時效性提出了極大要求,且隨着業務的不斷發展,活動不斷變換,運營人員就需要不斷地 ...
中國大牛力作 張澤民: http://gepia.cancer-pku.cn/index.html http://cancer-pku.cn/ ...
最出名,http://www.cbioportal.org/ 特色:最基本的簡單分析基因突變、共表達/共突變的基因,下載數據也可以,最常看的應該還是oncoPrint那個。 詳細用法:TCGA數據庫的數據怎么查? 最方便,Ge-mini 特色:手機app,可隨時查看,主要關注基因表達 ...
MatrixEQTL是一個快速有效的cis/trans eQTL mapping分析工具,被The Genotype-Tissue Expression (GTEx)數據庫用於eQTL mapping分析。使用MatrixEQTL進行eQTL mapping需要五個輸入文件,即SNP.txt ...