原文:多組學分析及可視化R包

最近打算開始寫一個多組學 包括宏基因組 S 轉錄組 蛋白組 代謝組 關聯分析的R包,避免重復造輪子,在開始之前隨便在網上調研了下目前已有的R包工具,部分羅列如下: . mixOmics 應該是在多組學領域知名度最高的一個R包,有專門的團隊,做了十余年了,引用量也比較高。 官網:http: mixomics.org 文章:mixOmics: An R package for omics featur ...

2020-03-30 13:01 0 4263 推薦指數:

查看詳情

可視化學分析軟件:MATLAB R2021a for Mac

未來軟件園為大家帶來了MathWorks系列的全新版本,MathWorks MATLAB R2021a簡稱為MATLAB R2021a,是一款可視化的專業數學分析軟件,這款軟件擁有分析數據、開發算法、創建模型,數據圖表,APP打包、APP開發等一系列功能。大家無論是分析數據、開發算法還是創建 ...

Wed Jun 23 18:57:00 CST 2021 0 180
MetaboAnalyst的多組學分析

MetaboAnalyst是做代謝的R,功能十分強大。也開發了web版本,代謝組學的分析這里不介紹,主要講講它開發的多組學分析的相關內容。 既然是做代謝的工具,即使是增加了多組學內容,肯定也是以代謝為核心。以代謝組為中心的多組學分析想想無非就是以下幾點:多元變量統計分析、網絡分析 ...

Fri Nov 22 17:56:00 CST 2019 0 2491
R語言的可視化

)、無序(不可比較) 1. 數值變量特征和可視化 集中趨勢測量(均值、中位數、眾數) 均值=(數 ...

Mon Jul 17 19:17:00 CST 2017 1 2244
可視化數據分析工具-CapAnalysis

可視化數據分析工具-CapAnalysis 我們知道,Xplico是一個從pcap文件中解析出IP流量數據的工具,本文介紹又一款實用工具—CapAnalysis(可視化數據分析工具),將比Xplico更加細致的分析功能,先別着急安裝,下面我們首先了解Pcap的基本結構,然后告訴你如何使用 ...

Tue May 20 03:24:00 CST 2014 0 4064
R語言——limma進行多組差異表達分析

目錄 1. 加載表達矩陣 2. 創建樣本分類表 3. 加載limma,構建如下矩陣 4. 規定哪一組數據與哪一組數據比較 5. 獲取差異表達數據 6. 導出差異表達數據 1. 加載表達矩陣 2. 創建樣本分類表 獲得類似 ...

Sun Mar 07 07:50:00 CST 2021 0 1681
R語言代寫生存分析數據分析可視化案例

目標 本文的目的是對如何在R中進行生存分析進行簡短而全面的評估。關於該主題的文獻很廣泛,僅涉及有限數量的(常見)問題/特征。可用的R數量反映了對該主題的研究范圍。 R 可以使用各種R來解決特定問題,並且還有替代功能來解決常見問題。以下是本次 ...

Tue Jun 25 01:00:00 CST 2019 0 521
汽車數據的可視化分析R

數據下載:http://www.fueleconomy.gov/feg/epadata/vehicles.csv.zip 將數據導入R中, 1.首先將工作路徑設定到本地保存了vehicles.csv的路徑下: 2.我們可以直接從zip文件中載入數據,只要你知道zip中壓縮 ...

Sun Feb 11 07:03:00 CST 2018 0 1076
R語言可視化之箱圖

lattice中的箱圖 bwplot(Species~Petal.Length,data=iris) 拓展:分位箱圖 library(Hmisc) bwplot(Species~Petal.Length,data=iris,panel=panel.bpplot ...

Fri Nov 24 05:40:00 CST 2017 0 1110
 
粵ICP備18138465號   © 2018-2025 CODEPRJ.COM