VCF和GVCF格式說明
注意：本文的內容主要來自於GATK官網的講解，所以vcf也是GATK產生的，用其他caller，比如varscan2產生的vcf文件的內容注釋可能不一致。 參考：https://gatkforums.broadinstitute.org/gatk/discussion/1268 ...
原文：VCF格式說明
VCF是用於描述SNP，INDEL和SV結果的文件，下面所記錄的是以GATK軟件結果的VCF文件，與SAMtools的結果有點不同 VCF文件可以分為兩部分看，最上面 號注釋的的部分是對一些參數的解釋 看英文能懂的話，下面的解釋就不用看了 ，而下面沒 號注釋的部分則是各個參數對應的具體的值 一般先關注以下幾列信息，從左到右為： CHROM ：染色體編號 POS：參考基因組上variant鹼基的位置 ...
2020-01-07 10:33 0 797 推薦指數：
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