使用"biomaRt"包進行基因ID轉換
1、安裝"biomaRt"包 2、"ensembl_transcript_id_version" 轉 "refseq_mrna", "ensembl_gene_id", "hgnc_symbol" 輸入文件file.txt如下所示： 轉換命令如下： 輸出文件new如下所示： ...
原文：bioMart進行基因id的轉換
.bioMart包的介紹 bioMart包是一個連接bioMart數據庫的R語言接口，能通過這個軟件包自由連接到bioMart數據庫，這個包可以做以下幾個工作： .查找某個基因在染色體上的位置。反之，給定染色體每一區間，返回該區間的基因 .通過EntrezGene的ID查找到相關序列的GO注釋。反之，給定相關的GO注釋，獲取相關的EntrezGene的ID .通過EntrezGene的ID查找到 ...
2019-12-17 15:40 0 9191 推薦指數：
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