原文:無標定量|有標定量|譜圖計數|XIC|AMT數據庫|RT對對齊|母離子|子離子|SILVER|SRM|iBAQ|APEX|差異蛋白篩選|MaxQuant|PANDA|C-HPP

生物醫學大數據 蛋白質定量 現今肽段定量效率存在巨大差異。比如相同質量蛋白質,但是肽段和蛋白信號不均一,在物理條件一致時,僅有 的重復率,並且當重復次數變多時,overlapping在變少。 無標定量法 方法一是針對二級色譜的譜圖計數,即統計二級色譜的數量,數量越多則蛋白豐度越高,但相同豐度蛋白也有不同的二級色譜數,所以算法目的是減少噪音。 方法二是針對一級色譜的離子流色譜峰XIC,即每個肽段的離 ...

2019-10-13 17:47 0 356 推薦指數:

查看詳情

【6】蛋白質組學鑒定定量軟件之MaxQuant

目錄 1.簡介 2.下載安裝 3.配置與運行 4.結果 5.Perseus后處理 6.小結 1.簡介 2016年,德國馬普所的Cox和蛋白質組學領域巨擘Matthias Mann合作開發了MaxQuant軟件(MQ),並發表在nbt ...

Sat Aug 29 07:48:00 CST 2020 1 7725
蛋白組學定量值得比較說明

1. MaxquantiBAQ和LFQ,該用哪個?我們使用Maxquant做Label Free蛋白質組學定量分析的時候,在Maxquant的參數設置時,會遇到兩個參數,LFQ和iBAQ,那么,選擇哪個好呢?如果你都選上,在最終的proteingroups.txt中,會出現三列 ...

Mon Oct 21 21:04:00 CST 2019 0 1368
【5】蛋白質組學鑒定定量軟件之PD

目錄 1.簡介 2.安裝與配置 3.分析流程 4.結果 1.簡介 PD全稱Proteome Discoverer,是ThermoFisher在2008年推出的商業Windows軟件,沒錯,收費,還不菲。而且主要也是針對他們家的obitrap產出數據 ...

Sat Aug 29 05:33:00 CST 2020 0 1961
SIMS(secondary ion mass spectroscopy)二次離子

1.儀器介紹 二次離子(SIMS)是一種用於通過用聚焦的一次離子束濺射樣品表面並收集和分析噴射的二次離子來分析固體表面和薄膜的組成的技術。SIMS是最靈敏的表面分析技術,元素檢測限為百萬分之幾到十億分之一。 Schematic of a typical dynamic SIMS ...

Sun Oct 14 23:36:00 CST 2018 0 906
離子燙攻略

一. 背景:中秋節在家,學一下如何做離子燙發,幫老婆做一下離子燙,希望可以成功. 二.材料:資生堂發膏堂熱燙軟化劑400ml+資生堂燙發水定型柔順劑400ml 三.操作流程:1.洗發水洗凈頭發(勿用護發素),用毛巾擦至約7成干先把軟化劑擠出放在調和碗里. 2.將頭發梳順,並用分區夾 ...

Sat Oct 09 18:09:00 CST 2021 0 128
離子噴塗

定義:一種材料表面強化和表面改性的技術; 功能:使基體表面具有耐磨、耐蝕、耐高溫氧化、電絕緣、隔熱、防輻射、減磨和密封等性能; 原理:采用由直流電驅動的等離子電弧作為熱源,將陶瓷、合金、金屬等材料加熱到熔融或半熔融狀態,並以高速噴向經過預處理的工件表面而形成附着牢固的表面層的方法 ...

Wed Feb 16 23:15:00 CST 2022 0 1398
NCB | 定量蛋白質組學揭示細胞外泌體通用標志物Syntenin-1

外泌體 (exosomes) 是由哺乳動物細胞通過“內吞-融合-外排”等機制,主動向胞外釋放的納米級 (直徑40~60 nm) 雙層囊泡小體,攜帶蛋白質、核酸、脂質等多種生物活性分子。越來越多的證據表明,外泌體是細胞間交流的重要媒介,它們可以將功能性分子轉移到受體細胞中,或參與受體細胞膜受體介導 ...

Wed Aug 11 23:56:00 CST 2021 0 167
 
粵ICP備18138465號   © 2018-2025 CODEPRJ.COM