原文:單細胞轉錄組測序技術及各類數據分析方法總結

自從 年單細胞轉錄組測序 single cell RNA seq,scRNA seq 技術首次問世,至今已經有幾十種不同的scRNA seq技術相繼被開發出來。在過去的十年里,單細胞轉錄組測序技術得到了蓬勃的發展,從而使得可在單細胞水平揭示全基因組范圍內所有基因的表達情況,可以更精准的開展細胞間的表達異質性研究 鑒定新的細胞亞型 解析早期胚胎的發育等。 單細胞測序流程 圖片來源 :http: le ...

2019-09-17 12:35 0 1696 推薦指數:

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單細胞轉錄測序技術原理

From: https://mp.weixin.qq.com/s/4dtXwK1KTLXndGvO5m2BEQ 單細胞測序主要涉及單細胞基因測序轉錄測序兩個方面,分別針對單細胞DNA及RNA進行序列分析和比較。單細胞測序一直是科學家關注的一個熱點。單細胞基因測序目前主要有兩種擴增方法 ...

Wed Jun 30 17:19:00 CST 2021 0 525
單細胞測序數據的差異表達分析方法總結

無論是傳統的多細胞轉錄測序(bulk RNA-seq)還是單細胞轉錄測序(scRNA-seq),差異表達分析(differential expression analysis)是比較兩不同樣本基因表達異同的基本方法,可獲得一樣本相對於另一樣本表達顯著上調(up-regulated)和下調 ...

Sat Sep 07 22:42:00 CST 2019 0 2592
單細胞轉錄測序技術(scRNA-seq)及細胞分離技術分類匯總

單細胞測序流程(http://learn.gencore.bio.nyu.edu) 在過去的十多年里,高通量測序技術被廣泛應用於生物和醫學的各種領域,極大促進了相關的研究和應用。其中轉錄測序(RNA-seq)被廣泛應用於測定和描繪各類物種的基因或轉錄 ...

Sat Sep 07 23:23:00 CST 2019 0 1442
scRNA-seq單細胞測序數據分析工具匯總

本文總結自一篇綜述: Computational approaches for interpreting scRNA-seq data 單細胞分析分為兩個層次: cell level gene level Tools for the visualization ...

Thu Jul 13 02:13:00 CST 2017 0 6366
單細胞轉錄CNV分析

什么是CNV? copy number variation (CNV) A copy number variation (CNV) is when the number of copies of ...

Fri May 07 22:49:00 CST 2021 0 210
轉錄數據分析思路

轉錄緊緊圍繞基因表達量和功能分析兩部分,結合生物學問題來進行數據分析。 高表達基因已經研究比較透徹,應該更多關注中低表達基因。 層次聚類的妙用: -- 全部基因——>(差異分析)——>根據趨勢挑選部分特異性基因——>功能分析; -- 功能大類聚類——> ...

Sun Jul 19 19:45:00 CST 2020 0 2013
《全基因測序WGS數據分析——1.DNA測序技術》學習筆記

WGS(Whole Genome Sequencing) 指將物種細胞里面完整的基因序列全部DNA,檢測並排列,此技術幾乎能夠鑒定出基因上任何類型的突變。 對於人類來說,全基因測序的價值是極大的,它的信息包含了所有基因和生命特征之間的內在關聯性,當然也意味着更大的數據解讀 ...

Tue Jun 29 19:59:00 CST 2021 0 161
 
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