AnnotationHub, clusterProfiler 進行GO，KEGG注釋
1⃣️ AnnotationHub 目前最新的工具包叫做AnnotationHub，顧名思義，就是注釋信息的中裝站。通過它，能找到了幾乎所有的注釋資源。如果沒有，你還可以根據已有的數據用它提供的函數進行構建。 1. 加載AnnotationHub library(AnnotationHub ...
原文：R包對植物進行GO，KEGG注釋
安裝，加載所用到到R包 用BiocManager安裝，可同時加載依賴包 source https: bioconductor.org biocLite.R BiocManager::install clusterProfiler library clusterProfiler 富集分析library topGO 畫GO圖library AnnotationHub 獲取數據庫library Bio ...
2019-09-16 20:07 0 3158 推薦指數：
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KEGG注釋
在 KEGG 數據庫中，把功能相似的蛋白質歸為同一組，然后標上 KO 號。通過相似性比對，可以為未知功能的蛋白序列注釋上 KO 號。 截止到 2015 年 6 月 12 日，KEGG 數據庫中共收錄了 3,904 個完整的基因組。其中 304 個為真核生物，3,600 個為原核生物。在真 ...
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