A survey of best practices for RNA-seq data analysis RNA-seq數據分析指南 內容 前言 各位同學/老師,大家好,現在由我給大家講講我的文獻閱讀報告! A survey of best practices ...
可變剪切的預測已經很流行了,目前主要有兩個流派: 用DNA序列以及variant來預測可變剪切 GeneSplicer MaxEntScan dbscSNV S CAP MMSplice clinVar spliceAI 用RNA來預測可變剪切 MISO rMATS DARTS 前言廢話 科研圈的熱點扎堆現象是永遠存在的,且一波接一波,大部分不屑於追熱點且不出成果也基本都被圈子給淘汰了。 做純方法 ...
2019-08-29 21:39 0 460 推薦指數:
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Salmon 概述 該軟件采用新的雙階段(dual-phase)統計推斷程序,以及針對每個樣本存在sequence-specific, fragment GC-content, 和 position ...
與之對應的是single cell RNA-Seq,后面也會有類似文章。 參考:https://github.com/xuzhougeng/Learn-Bioinformatics/ 作業:RNA-seq基礎入門傳送門 資料:RNA-seq Data Analysis-A Practical ...
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 隨着ome為詞尾的各種組學的出現,轉錄組學已經成為了人們了解生物信息的一個重要組成部分。人們使用了許多辦法來掌握轉錄組的情況,主要分為兩類,一類是基於雜交,一類是基於下一代測序技術 ...
簡單理解RNA-seq 劉小澤 已關注 2018.10.17 23:51* 字數 1518 閱讀 46評論 0喜歡 3 今天就當一個小故事看吧,看了statQuest,感覺講的很棒,於是分享給大家原版視頻后台回復 ...
Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a tutorial 摘要 這篇文章主要闡述了一個典型的單細胞 RNA-seq 分析的詳細流程,包括了以下流程: pre-processing -數據預處理 ...
業界良心啊,開源的單細胞課程。 隨便看了幾章,課程寫得非常用心,非常適合新手。 課程地址:Analysis of single cell RNA-seq data 源碼地址:hemberg-lab/scRNA.seq.course ...
無生物學重復RNA-seq分析 CORNAS: coverage-dependent RNA-Seq analysis of gene expression data without biological replicates BMC Bioinformatics 的一篇文章中提出了一種新 ...