原文:5.MCScanX 與circos下載、安裝、運用

一 MCSCAN 參考 :http: chibba.pgml.uga.edu mcscan MCScanX.zip http: chibba.pgml.uga.edu mcscan tm 安裝 :unzip MCscanX.zip amp amp cd MCScanX amp amp make 安裝報錯: 報錯解決: 這個錯誤的原因是,MCScanX 不支持 位系統。如果要在 位上運行,需要修改下 ...

2019-07-25 20:02 0 642 推薦指數:

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從基因組可視化工具——circos說起,circos安裝

這是博客改版的第一篇博文,選擇最近使用的生物信息學軟件——circos開始寫起。circos是用perl寫的生物軟件,從發表的文章來看 學習circos主要是熟悉配置文件的編輯方法,搞清楚其中的標簽、參數的含義。只有完全清楚了這些東西才能夠輕松自如的讓circos ...

Thu Jul 28 19:02:00 CST 2016 0 2308
Circos

Circos官網 http://circos.ca 在線繪圖工具 http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/ Circos圖的誕生 Circos圖誕生於2009年,當時是作為一個繪圖工具類的文章發表在Genome Research(最新 ...

Mon Sep 16 17:58:00 CST 2019 0 503
Selenium運用-漫畫批量下載

今天我們要爬去的網站是http://comic.sfacg.com/。漫畫網站一般都是通過JavaScript和AJAX來動態加載漫畫的,這也就意味着想通過原來爬取靜態網站的方式去下載漫畫是不可能的,這次我們就來用Selenium&PhantomJS來下載漫畫。 分析 ...

Sun Aug 27 06:59:00 CST 2017 0 1177
Circos繪圖—基礎

之前看過一張關於人口遷徙的圖,感覺很驚艷,后面了解到Circos這個工具,雖然主要是用於染色體基因組的圖的繪制,但是在其他方面也是有着很好的可視化效果 汽車交易中的用戶行為模式追蹤 How do customers "flow" between brands and car segments ...

Sat Feb 15 07:29:00 CST 2020 0 4343
Circos入門教程

1 Circos簡介 Circos是一個非常酷炫的基因組數據可視化軟件,能夠將基因組數據映射到環形的基因組坐標上,用相互嵌套的環道來展示基因組數據,還可以通過連接線來呈現基因組區塊之間的關系。Circos的開發者是一位加拿大的生物信息學家Martin Krzywinski,值得一提的是 ...

Fri Nov 12 19:00:00 CST 2021 0 13012
Circos軟件學習

  circos 是一款perl 語言開發的畫圖軟件,提供了染色體相關數據的一種可視化方式。其制作的圖表精美,被科研工作者廣泛使用。Circos可以對染色體相關數據進行可視化,以每條染色體為一個扇區,組成一個圓形,如圖1所示。也可以對其他表格形式的數據進行可視化,以每個樣本作為扇區,以其上的特征 ...

Sun May 10 19:36:00 CST 2020 0 724
requests的安裝與簡單運用

參考鏈接 http://www.zhidaow.com/post/python-requests-install-and-brief-introduction 1. 安裝 下載安裝包地址:https://github.com/requests/requests.git ...

Thu Jul 12 19:15:00 CST 2018 1 3508
 
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