為了查找某個研究領域的相關信息,生物學家往往要花費大量的時間,更糟糕的是,不同的生物學數據庫可能會使用不同的術語,好比是一些方言一樣,這讓信息查找更加麻煩,尤其是使得機器查找無章可循。Gene Ontology就是為了解決這種問題而發起的一個項目。 Gene Ontology中最基本的概念 ...
Gene Ontology GO 注釋 Posted on In生信 相似的基因在不同物種中,其功能往往保守的。顯然,需要一個統一的術語用於描述這些跨物種的同源基因及其基因產物的功能,否則,不同的實驗室對相同的基因的功能的描述不同,將極大限制學術的交流。而 Gene Ontology GO 項目正是為了能夠使對各種數據庫中基因獲基因產物功能描述相一致的努力結果。 所謂的 GO,是生物學功能注釋的一 ...
2019-07-11 16:43 0 530 推薦指數:
為了查找某個研究領域的相關信息,生物學家往往要花費大量的時間,更糟糕的是,不同的生物學數據庫可能會使用不同的術語,好比是一些方言一樣,這讓信息查找更加麻煩,尤其是使得機器查找無章可循。Gene Ontology就是為了解決這種問題而發起的一個項目。 Gene Ontology中最基本的概念 ...
gene ontology為了查找某個研究領域的相關信息,生物學家往往要花費大量的時間,更糟糕的是,不同的生物學數據庫可能會使用不同的術語,好比是一些方言一樣,這讓信息查找更加麻煩,尤其是使得機器查找無章可循。Gene Ontology就是為了解決這種問題而發起的一個項目。 Gene ...
本體網絡(Ontology) 新一代分布式信任鏈網 在開始了解項目之前,讓我們先看一段“第一財經”頻道關於“本體網絡”的介紹: 項目介紹 1摘要 類型 提供不同分布式應用場景的開放基礎模塊,構建跨鏈、跨系統、跨行業、跨應用和跨終端的分布式信任基礎設施 ...
如果轉載,請注明出處。 GSEA、David與KEGG、GO數據庫的區別: 1.KEGG數據庫、GO數據庫是知識庫。它們記錄了通路、生物學過程等的信息。 2.GSEA、David是做富集分析的數據庫。它們使用KEGG、GO數據庫中的信息,再結合你輸入的基因列表,對輸入基因列表進行富集 ...
1、GO資源簡介 由於生物系統的驚人復雜性和需要分析的數據集的不斷增加,生物醫學研究越來越依賴於以可計算的形式存儲的知識。基因本體論(GO)項目為基因功能和基因產物的可計算知識提供了目前最全面的資源。GO知識庫由兩個主要部分組成: 基因本體論Gene Ontology (GO),提供了生物功能 ...
GWAS研究中經常涉及到基因座(locus)的概念,下面簡要介紹一下批量注釋基因到基因座的方法。 1、單個基因注釋到基因座 對於單個基因的基因座注釋,比較簡單,常用的工具有:UCSC Genome Browser、NCBI。 比如UCSC Genome Browser: 還有NCBI ...
本文主要是對沒有GO term庫的植物進行注釋。 1、選用AgriGo 進行注釋,在agriGO中點擊species后,查看與你目標物種相近的物種作為庫 2、比如我以甜菜為例 為了找到和GO term對應的ID,先找到PLAZA,進入網站https ...
我們是在驗證時才使用注釋,這種拿不准確數據來驗證新的數據的方法確實值得思考。 那么GO和KEGG常見注 ...