原文:基因表達半衰期 | mRNA Half-Life

做單細胞RNA seq分析,自然就能想到我們測到的其實是一個概率學的東西,就像女士品茶里的酵母的泊松分布一樣。 真實的細胞里,一切都是連續的,從DNA到mRNA到蛋白,是有一個時間間隔的,每一個process也不是瞬間完成的,而是有一個周期,我們可以叫做半衰期。 看一篇文獻先:Database for mRNA Half Life of Genes Obtained by DNA Microarr ...

2019-07-09 20:29 0 416 推薦指數:

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Half-Life】 Steam 安裝半條命模組

安裝辦法參考自B站UP主【百科全叔】的文章 半條命模組在ModDB站上下載資源 mod文件位置 一些模組是可以直接運行的,下載解壓后雙擊目錄 ...

Tue Mar 01 05:26:00 CST 2022 0 1408
真核生物基因結構 & mRNA結構

參考: 分子生物學教材 再一次,翻看真核生物基因結構! mRNA基本結構特點 Structure and function of Messenger RNA (mRNA ) 基因結構 其實這個結構不完整,完整的如下: 主要注意UTR這個結構 真核生物的基因 ...

Thu Feb 16 18:51:00 CST 2017 0 8612
基因表達

做RNA-seq的數據分析,一直弄不清楚實驗過程,最近有時間就找一些資料來了解一下,同時將整理的資料記錄下來,方便以后查找。 來源資料:【3D演示】基因表達(原版+字幕版) 人體從食物中獲取營養的過程也就是化學消化過程,是通過酶對食物進行分解來得到營養物質。DNA用來制造酶和各種蛋白質。DNA ...

Wed Jun 24 00:11:00 CST 2020 0 1411
用TCGA收集的mRNA表達數據作差異表達

做差異表達的軟件DEseq和edgeR所需要的數據格式必須是原始counts,經過normalization和log2后的數據都不適合,所以對於做差異表達計算的童鞋可以使用ExperimentHub下載TCGA的原始數據。 GEO地址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

Thu Aug 11 19:26:00 CST 2016 0 2200
基因表達式編程

基因表達式編程(Gene Expression Programming,GEP)是由葡萄牙科學家Candida Ferreira 2001年提出來的一種新型遺傳算法,其特點是將基因型和表現型分離。GEP 繼承了GA的快速、易用和GP的易變、多能,比GA,GP提高速度100 - 1000000倍 ...

Tue Mar 31 21:30:00 CST 2020 0 1096
基因功能 & 基因表達調控)研究方案

做了好久的RNA-seq分析,基因表達也在口頭溜了幾年了,但似乎老是浮在表面。 對一件事的了解程度決定了你的思維深度,只想做技工就不用想太多,想做大師就一定要刨根問底。 老是說基因表達,那么什么是基因表達?我們測序得到的基因表達其實只是一種表型,是樣本的一個快照,和普通的身高體重之類的連續型 ...

Wed Jun 12 22:35:00 CST 2019 0 1199
ConsensusClusterPlus根據基因表達量對樣品進行分類

#http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2881355/ 一致聚類方法,采用重抽樣方法來驗證聚類合理性。 library(ALL)data(ALL)d=exprs(ALL)d[1:5,1:5] #對上面這個芯片表達數據我們一般會簡單的進行 ...

Mon Sep 12 23:14:00 CST 2016 2 4068
用R和BioConductor進行基因芯片數據分析(六):差異表達基因

接前一篇: 用R和BioConductor進行基因芯片數據分析(五):芯片間歸一化 經過一系列的預處理,包括缺失值填充,中位數計算以及歸一化,我們的數據終於可以用啦。 下面我們就來分析一下new population和old population的個體是否有差異表達基因。 判斷一個基因是否 ...

Thu Dec 06 01:25:00 CST 2012 0 7165
 
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