原文:(基因功能 & 基因表達調控)研究方案

做了好久的RNA seq分析,基因表達也在口頭溜了幾年了,但似乎老是浮在表面。 對一件事的了解程度決定了你的思維深度,只想做技工就不用想太多,想做大師就一定要刨根問底。 老是說基因表達,那么什么是基因表達 我們測序得到的基因表達其實只是一種表型,是樣本的一個快照,和普通的身高體重之類的連續型表型類似。 常規的轉錄組分析本質上都是表型分析,clustering pseudotime DEG mark ...

2019-06-12 14:35 0 1199 推薦指數:

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哪些因素會導致基因功能的改變

基因結構分為:啟動子區,編碼區,終止子區 編碼區包括內含子和外顯子,其中內含子在mRNA修飾的時候,會被剪切,最終,蛋白質由外顯子mRNA翻譯而成。 啟動子區的功能是結合轉錄因子,促進轉錄,如果啟動子區發生突變,有可能造成轉錄因子無法結合,從而導致基因表達甚至不表達。 編碼區中,外顯子 ...

Thu Nov 25 05:32:00 CST 2021 0 1040
基因表達

做RNA-seq的數據分析,一直弄不清楚實驗過程,最近有時間就找一些資料來了解一下,同時將整理的資料記錄下來,方便以后查找。 來源資料:【3D演示】基因表達(原版+字幕版) 人體從食物中獲取營養的過程也就是化學消化過程,是通過酶對食物進行分解來得到營養物質。DNA用來制造酶和各種蛋白質。DNA ...

Wed Jun 24 00:11:00 CST 2020 0 1411
淺析GENIE3基因調控網絡推斷

GENIE3 GENIE3(GEne Network Inference with Ensemble of trees), 使用基於樹的集成學習算法,來通過基因表達數據來推斷基因調控網絡。 小知識點: GENIE3末尾的3並不是指GENIE的第三版本,而是因為通過法語口音來發音的話 ...

Wed Mar 31 04:33:00 CST 2021 0 481
用python包networkx繪制基因調控網絡

最近需要繪制基因調控網絡,選擇了python語言中比較popular的networkx包,先上目前結果圖: 節點是基因或者其他實體,邊代表調控關系,黑色的邊代表抑制,紅色的邊代表激活,紅色的節點代表自我激活,黑色的節點代表自我抑制。 繪制的關鍵點:邊可以有不同的顏色,指向符號可以修改 ...

Tue Jul 28 17:39:00 CST 2020 0 566
基因調控網絡 (Gene Regulatory Network) 01

本文為入門級的基因調控網絡文章,主要介紹一些基本概念及常見的GRN模型。 概念:基因調控網絡 (Gene Regulatory Network, GRN),簡稱調控網絡,指細胞內或一個基因組內基因基因之間的相互作用關系形成的網絡,特指基因調控 (gene regulation) 導致基因 ...

Sun Feb 16 05:46:00 CST 2020 0 5387
基因療法研究報告

基因療法研究報告 作者:郭敏 人工智能對醫療和健康產業的沖擊和革命 文章分四部分: 1、基因治療的現狀與前景(存在的困難、基因治療的技術) 2、基因治療與大數據的關系 3、基因治療與人工智能的關系 4、個人看法 第一部分:基因治療的現狀與前景 人類細胞 ...

Wed May 31 04:44:00 CST 2017 16 314
 
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