可變剪切調控因子motif基因富集分析 | motif enrichment | FIMO | MEME
類似篇：轉錄因子motif TSS區域富集分析 | motif enrichment | HOMER | FIMO | MEME 一個新的領域，現在我關注的是可變剪切調控因子，如PTBP1，它們有特定的RNA結合motif，類似TF。 相同點： 都是蛋白質的序列結合區域 ...
原文：HOMER | MEME | 轉錄因子的靶基因預測 | motif富集分析
轉錄因子motif是一些很短的模序 bp ，在大基因組里很容易出現隨機比對，而且是以position weight matrix PWM 格式來呈現，說明它的可變性，因此研究motif有哪些binding區域是沒有意義的，因為很難找到一個方法 閾值 來判斷真正的比對和隨機的比對。 換個思路，如果做富集分析，那就穩了，給定一個指定的區域 promoter或enhancer區域 ，根據統計學檢驗，我 ...
2019-04-17 12:49 0 4103 推薦指數：
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