原文:生物信息軟件安裝(不定時更新)

以本地電腦wsl子系統的unbantu為例 軟件安裝 anaconda安裝與配置 下載Anaconda . for Linux https: www.anaconda.com download 在下載目錄下輸入 點yes往下后,輸入查看是否安裝成功 結果為 更新環境配置 增加源 channels 現在anconda下載好了 .faToTwoBit安裝 將fasta格式改為 . bit格式 .安裝 ...

2018-12-24 13:54 0 939 推薦指數:

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安裝生物信息軟件-bowtie2

好吧,這是本周(2016.10.21-28)的學習任務之一:安裝bowtie2並學習其使用方法&參數設置 所以,啃文檔咯,官方文檔Version 2.2.9 http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/manual.shtml 以下是我的整理 ...

Sun Oct 23 20:44:00 CST 2016 0 1439
生物信息bowtie比對軟件的結果格式說明

生物信息分析中會用到很多的比對軟件,比較常用的有bowtie、bowtie2、bwa等,比對文件的標准格式是sam格式,但是bowtie比對默認輸出的格式卻不是sam格式,由於bowtie適用於短序列比對,並且看突變鹼基比較方便,因此它的默認輸出格式還是有一定優勢的,下面就來說明一下 ...

Fri May 10 21:12:00 CST 2019 0 580
生物信息學在線軟件集錦

序列相關 密碼子表達優化:Jcat 核酸翻譯為蛋白:Translate 序列比對和搜索:NCBI Blast,Uniprot Blast,HMMER,HHblits 序列比對的作圖 ...

Wed Sep 02 22:49:00 CST 2020 0 437
生物信息學在線軟件集錦

生物信息學分析在線軟件集錦 序列相關 密碼子表達優化:Jcat 核酸翻譯為蛋白:Translate 序列比對和搜索:NCBI Blast,Uniprot Blast,HMMER,HHblits 序列比對的作圖 ...

Tue Dec 21 17:47:00 CST 2021 0 103
Homebrew 安裝更新軟件

brew brew install 安裝 brew uninstall 卸載 brew update 更新 homebrew brew upgrade 安裝更新軟件 brew cleanup 清理 brew cask 安裝 cask ...

Thu Apr 04 23:19:00 CST 2019 0 3099
生物信息 perl 腳本實戰

索引 1.統計fasta、fa和fastq文件的長度,統計fastq的reads個數,單個reads長度,reads總長度;統計fasta文件中contig的個數,列出名稱,單條的長度,以及總長 ...

Fri Aug 12 00:17:00 CST 2016 0 3716
生物信息】RPKM, FPKM和TPM

注:這幾個名詞是RNA-Seq數據分析中的基礎,在此小結一下。 在RNA-Seq的分析中,對基因或轉錄本的read counts數目進行標准化(normalization)是一個極其重要的步驟 ...

Mon Jul 06 23:38:00 CST 2020 0 6012
 
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