/wiki/metaphlan2 MetaPhlAn2是使用宏基因組鳥槍法測序數據描繪微生物群落組成 ...
以本地電腦wsl子系統的unbantu為例 軟件安裝 anaconda安裝與配置 下載Anaconda . for Linux https: www.anaconda.com download 在下載目錄下輸入 點yes往下后,輸入查看是否安裝成功 結果為 更新環境配置 增加源 channels 現在anconda下載好了 .faToTwoBit安裝 將fasta格式改為 . bit格式 .安裝 ...
2018-12-24 13:54 0 939 推薦指數:
/wiki/metaphlan2 MetaPhlAn2是使用宏基因組鳥槍法測序數據描繪微生物群落組成 ...
好吧,這是本周(2016.10.21-28)的學習任務之一:安裝bowtie2並學習其使用方法&參數設置 所以,啃文檔咯,官方文檔Version 2.2.9 http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/manual.shtml 以下是我的整理 ...
生物信息分析中會用到很多的比對軟件,比較常用的有bowtie、bowtie2、bwa等,比對文件的標准格式是sam格式,但是bowtie比對默認輸出的格式卻不是sam格式,由於bowtie適用於短序列比對,並且看突變鹼基比較方便,因此它的默認輸出格式還是有一定優勢的,下面就來說明一下 ...
序列相關 密碼子表達優化:Jcat 核酸翻譯為蛋白:Translate 序列比對和搜索:NCBI Blast,Uniprot Blast,HMMER,HHblits 序列比對的作圖 ...
生物信息學分析在線軟件集錦 序列相關 密碼子表達優化:Jcat 核酸翻譯為蛋白:Translate 序列比對和搜索:NCBI Blast,Uniprot Blast,HMMER,HHblits 序列比對的作圖 ...
brew brew install 安裝 brew uninstall 卸載 brew update 更新 homebrew brew upgrade 安裝已更新軟件 brew cleanup 清理 brew cask 安裝 cask ...
索引 1.統計fasta、fa和fastq文件的長度,統計fastq的reads個數,單個reads長度,reads總長度;統計fasta文件中contig的個數,列出名稱,單條的長度,以及總長 ...
注:這幾個名詞是RNA-Seq數據分析中的基礎,在此小結一下。 在RNA-Seq的分析中,對基因或轉錄本的read counts數目進行標准化(normalization)是一個極其重要的步驟 ...