原文:Lammps命令與in文件

LAMMPS 即 Large scale Atomic Molecular Massively Parallel Simulator 大規模原子分子並行模擬器 ,是由美國能源部桑迪亞國家實驗室開發的一種開源的經典分子動力學模擬代碼 in文件描述一個符合牛頓定律的模擬過程,內容大致包含三個部分: 構建所模擬的體系,創造一個模擬環境的以及最后輸出想得到的數據 一 各類文件 in :程序寫入 log : ...

2019-01-07 20:33 3 3224 推薦指數:

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lammps--命令注意

1.create_box  這個關鍵字看似簡單實則讓人難受。   ①在寫這個關鍵字的時候切記:一一對應原則,即:     bond/types  對應  extra/bond/per/atom ...

Fri Jul 10 04:09:00 CST 2020 0 579
lammps_data文件

一、notes: 1、不在data文件里寫“#”(注釋),否則,容易出錯; 2、前兩行不用寫東西(建議); 3、相互作用系數可以不用寫在data里邊(如pair_coeff等),可有可無,but for pair_coeff,最好還是在data文件中設定,因為它比在in文件中設定更加方便 ...

Sat May 04 23:46:00 CST 2019 0 1669
LAMMPS中的系綜(NPT/NVT)命令

語法: ID 是fix名,group-ID是fix所作用的群組名。這兩個是所有fix命令都需要的。 style_name可以選擇NVT、NPT或者NPH 關鍵詞keyword和對應的數值value可以添加 例子: 詳細 ...

Sat Apr 10 16:12:00 CST 2021 0 855
lammps計算的應力的方法

摘自:http://dxli75.blog.163.com/blog/static/106768289201142893419587/ lammps計算的應力有兩種: 一是體系整體的應力狀態,通過在thermo_style custom里加上pxx pyy pzz pxy pxz pyz字段 ...

Sun May 05 00:37:00 CST 2019 0 2196
lammps溫度雲圖

轉自:小木蟲 田淮安 的回答。 LAMMPS中的溫度是由原子的動能計算而來的,具體可參見手冊compute temp command一節的說明。LAMMPS的模擬結果,我這里指的是dump命令得到的lammpstrj文件,主要內容都是每個時刻每個原子的信息,包括坐標、速度、動能、勢能 ...

Fri Jun 26 00:04:00 CST 2020 4 2215
lammps 計算熱導率

原文連接:http://mdbbs.org/thread-19218-1-1.html 看到有不少人在找熱導率計算方面的in文件,我就貢獻三個in文件吧,僅供參考。同時,附件里貼出了我的計算結果。EMD的輸出結果(compute heat/flux command+compute tc ...

Sat Jun 20 04:48:00 CST 2020 8 2396
關於LAMMPS輸出【Output】的問題

無論任何模擬,我們都是想從模擬中得到我們想要的數據【data】,然后分析這些數據,從而提取出相關的信息【MAYBE新的發現】,那么數據的輸出是必然的一道程序,下面談談LAMMPS軟件是如何輸出data。LAMMPS中處理的輸出數據主要分一下三個大的部分:1.斷點數據,這個主要是為了防止模擬過程中 ...

Sun Apr 11 05:36:00 CST 2021 0 427
 
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