轉錄組分析工具大比拼 文獻閱讀與翻譯 - Gaining comprehensive biological insight into the transcriptome by performing a broad-spectrum RNA-seq analysis (Nature ...

什么是轉錄因子？ 轉錄因子 轉錄因子基本介紹 什么是轉錄因子？ 轉錄因子（Transcriptionfactor，TF)是一個能與特異DNA序列結合的蛋白,可以單獨或與其他蛋白形成復合體，提高或阻斷特性基因對RNA聚合酶的招募,調控着基因的表達。轉錄 ...

作業要求： 比對軟件很多，首先大家去收集一下，因為我們是帶大家入門，請統一用hisat2，並且搞懂它的用法。 直接去hisat2的主頁下載index文件即可，然后把fastq格式的reads比對上去 ...

“三代轉錄組”是什么？對於混跡在科研領域的一員，如果現在還不了解全長轉錄組測序，恐怕都不好意思說自己了解高通量測序了呢！ 今天小編總結了一些三代全長轉錄組測序的相關問題，給大家來一個詳細全面的解釋，希望可以幫到愛學習的您哦！ 1.什么是三代全長轉錄組測序 三代全長轉錄組測序，即利用 ...

最近在研究轉錄本，現在在下載數據，想起來自己有一個博客，就暫且來這里更新一下內容。 要想對轉錄本進行定量，首先需要下載它的轉錄組數據，將別人上傳的SRR文件的名字整理在wheat.txt中，引用 下載后通過sratoolkits將sra數據轉化成fq格式 --split-3將sra ...

轉錄組的組裝Stingtie和Cufflinks Posted: 十月 18, 2017 Under: Transcriptomics By Kai no Comments 首先這兩款軟件都是用於基於參考基因組的轉錄組組裝，當然也可用於轉錄本的定量。前者於2016年 ...

scRNA-seq做完該做的QC、normalization、imputation、clustering、trajectory和integration，就會開始做轉錄調控的分析了。 核心就是圍繞着TF轉錄因子做文章 預測TF的靶基因 鑒定regulon 大部分都是高通量的預測 ...

任務列表 比對軟件 hisat2的用法 下載index文件 比對、排序、索引 質量控制 載入IGV，截圖幾個基因 hisat2的用法 ...