1、安裝samtools 軟件中 遇到如下錯誤： 2、解決辦法： 參考：https://support.huaweicloud.com/topic/199412-5-Q ...

1、安裝samtoos軟件過程中遇到如下報錯： 2、解決方法，參考：http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=3249515&do=blog&id=1012337 ...

1、安裝samtools軟件過程中遇到如下錯誤： 2、解決辦法： 參考：https://github.com/samtools/htslib/issues/702 ...

主要介紹一下 SAMtools 的用法。它被譽為 NGS 里面的 瑞士軍刀，功能很是強大，所以值得好好學習一番。 文檔參考 總站 samtools-mannual github-samtools 標准流程 推薦： blog SAMtools: Primer ...

有很多種格式來記錄mapping的結果，大多數都收錄在UCSC的幫助文檔中。在mapping之后，如何對mapping的結果進行評估呢？ 最簡單的，就是通過samtools來評估mapping質量了。 samtools idxstats aln.sorted.bam 注意，這一步之前需要 ...

方便人們的使用。 軟件是功能，功能的實現是靠軟件。 計算機造出來了，但是普通人是無法使用的。因為沒有軟件，無法操作。 后來安裝了操作系統，可以操作了，但是很繁瑣，得專業人士才能記住那些命令。 再后來為普通用戶開發了軟件，帶有界面，人們可以直觀的操作，計算機才推廣 ...

對於雙端比對的數據，生成的BAM文件中，R1端序列和R2端序列的標識符是一樣的，之前一直不知道如何根據bam文件區分哪條序列是R1端，哪條序列是R2端，昨天仔細研究了一下，原來代表R1端和R2端的信息 ...

源自：http://sanwen.net/a/hirxmpo.html samtools是一系列處理bam和sam格式文件的應用程序集合，具有眾多的功能。 首先呢，bam和sam文件主要是bwa、bowtie、tophat等序列比對工具產生的，這些軟件我們后面會談到。 軟件下載安裝： 地址 ...