用 python 實現如下: 運行結果: ...
在生物信息學分析中,經常對DNA序列進行一系列操作,包括子序列截取,互補序列獲取,反向序列獲取,反向互補序列獲取。在python語言中,可編寫如下函數完成這些簡單功能。 子序列截取 python中對序列截取使用字符串切片功能就可以完成,例如: 注意,切片操作是 base 的,包左不包右。 互補序列獲取 比較常見的做法是定義一個鹼基替換字典,如下所示: 使用python 字符串使用的transla ...
2018-07-18 20:59 0 3217 推薦指數:
用 python 實現如下: 運行結果: ...
代碼如下: 這是將從一個txt文件中導入序列,然后將互補后的結果輸出到另外一個文件中。 如果一個段序列不長,直接中python交互式界面完成感覺更方便 先定義的一個字典: complement = {'C': 'G', 'G': 'C', 'T ...
1. 原理 對於DNA序列,一階馬爾科夫鏈可以理解為當前鹼基的類型僅取決於上一位鹼基類型。如圖1所示,一條序列的開端(由B開始)可能是A、T、G、C四種鹼基(且可能性相同,均為0.25),若序列的某一位是A,則下一位鹼基是A、T、G、C的概率分別為0.25、0.20、0.20、0.20,下一 ...
方法一:reverse函數 方法二:采用切片 ...
1. reversed() 2. range(len(a)-1, -1, -1) 3. range(len(a)) + ~操作符 ~按位取反運算符:對數據的每個二進制位取反,即把1變為0,把0變為1 。~x 類似於 -x-1 PS:遇到問題沒人解答?需要Python學習資料 ...
1. reversed() 2. range(len(a)-1, -1, -1) 3. range(len(a)) + ~操作符 ~按位取反運算符:對數據的每個二進制位取反,即把1 ...
DropBox就不用介紹了吧,是雲同步的軟件,雖然現在國內這種網盤太多了,但是論功能,真心的與DropBox差遠了。 今天折騰了一下DropBox的外鏈,哈哈,超級不錯。 當然了好處也多多,以后的圖片可以不用傳到又拍網,或者自己的空間了。省了空間流量還剩 了時間,最重要的是Dropbox ...
如果你明白了原理其實挺簡單的。 加密算法是python自帶的 需要導入hashlib import hashlib as hash sha = hasher.sha256() sha.update('your content') print sha.hexdigest() 輸出 ...