如何得到給定序列的互補序列以及反向互補序列

用 python 實現如下:

#!/usr/bin/python
# Complementing DNA

my_dna = "ACTGATCGATTACGTATAGTATTTGCTATCATACATATATATCGATGCGTTCAT"
# 由於python 區分大小寫，所以先替換成小寫可以有效避免后面重復替換的問題。
complement_AT = my_dna.replace("A","t")
complement_TA = complement_AT.replace("T","a")
complement_GC = complement_TA.replace("G","c")
complement_CG = complement_GC.replace("C","g")
# 把所以小寫變為大寫即可。
complement_DNA = complement_CG.upper()
reverse_complement_DNA = complement_DNA[::-1]  # str[::-1] used to reverse the string

print(complement_DNA)
print(reverse_complement_DNA)

運行結果：

ubuntu$ python3 complement_py3.py 
TGACTAGCTAATGCATATCATAAACGATAGTATGTATATATAGCTACGCAAGTA
ATGAACGCATCGATATATATGTATGATAGCAAATACTATACGTAATCGATCAGT