原文:將vcf文件轉化為plink格式並且保持phasing狀態

VCFtools can convert VCF files into formats convenient for use in other programs. One such example is the ability to convert into PLINK format. The following function will output the variants in.pedan ...

2018-07-08 14:31 0 1539 推薦指數:

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plink格式文件轉化為vcf文件VCF versions convert)

plink1.9版本支持轉化為VCFv4.2格式 plink2.0版本支持轉化為VCFv4.3格式 兩個版本用到的命令不一樣 對於plink1.9版本,轉化為vcf文件的命令行為: 生成的vcf為4.2版本 對於plink2.0版本,轉化為vcf文件的命令行 ...

Fri Mar 16 00:17:00 CST 2018 0 3147
vcf格式文件轉化為Excel(csv)格式文件(R語言的write.csv,write.table功能,Excel表的文件導入功能)

最近在整理文件,准備把vcf文件轉化為Excel格式,或者CSV格式,網上搜了一堆資料,還真有人專門開發出轉化格式的工具:叫vcf2csv(下載地址http://vcf2csv.sourceforge.net/#links),趕緊下載安裝,開始轉化,結果彈出行列不一致的錯誤,遂放棄。 嘗試了一堆 ...

Tue Aug 15 00:12:00 CST 2017 0 2371
python實現將android手機通訊錄vcf文件轉化為csv

經常會遇到將手機通訊錄導出到電腦並轉化為在電腦中可編輯的情況,在網上搜索了很久當前不外乎兩種處理方式。1.使用電腦的outlook的通訊簿功能,將手機導出的vcf文件導入到outlook的通訊錄中,然后再導出為可編輯文件;2.是使用專用軟件直接打開vcf文件。很不幸兩種都不適合我,第一種導出 ...

Mon Mar 25 04:35:00 CST 2019 0 843
使用plink將基因型轉化為0,1,2

如果想將基因型轉化為0,1,2 可以使用命令:plink --bfile file --recodeA --out recodefile 如果想將基因型轉化為0,1 可以使用命令:plink --bfile file --recodeD --out recodefile 如果想將基因型同時轉化為 ...

Wed Jul 08 23:57:00 CST 2020 0 964
通過Matlab將Raw格式文件轉化為Bmp格式圖片

在處理Raw格式文件轉變為Bmp格式的圖片時,一般要預先得知圖片的大小,在這里采用的是512*512大小,下面是一段Matlab實現的Raw2Bmp的代碼。 需要將Raw格式文件放在和Matlab的.m文件的同一個文件夾內。 ...

Wed Mar 18 08:11:00 CST 2020 0 929
用vba把excel文件發布轉化為pdf格式文件

將工作薄每一個工作表導出為PDF文件。   將當前工作表導出為PDF文件。 VBA 參考文檔 https://msdn.microsoft.com/zh-cn/VBA/Excel-VBA/articles ...

Tue Sep 11 04:35:00 CST 2018 0 2307
 
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