vcf格式文件轉化為Excel(csv)格式文件(R語言的write.csv,write.table功能,Excel表的文件導入功能)


最近在整理文件,准備把vcf文件轉化為Excel格式,或者CSV格式,網上搜了一堆資料,還真有人專門開發出轉化格式的工具:叫vcf2csv(下載地址http://vcf2csv.sourceforge.net/#links),趕緊下載安裝,開始轉化,結果彈出行列不一致的錯誤,遂放棄。

嘗試了一堆無用的工具以后,想着能不能用R的write.csv來實現轉化,結果順利解決。現將示例代碼演示一下:

data<-read.table("/path/data.vcf",header=F)
write.csv(data,file="/path/data.csv",row.names=FALSE)

  其實就是一個讀入寫出的過程,非常簡單!

還有另外一個方法:

打開一個新建的Excel表,點擊數據→自文本:

 選中你想導入的vcf文件,點擊“導入”:

 選中分隔符號,點擊下一步:

 

 選中“空格”,點擊下一步:

 點擊“完成”

 選中“現有工作表”,也可以選擇“新工作表”,點擊“確定”,自從,文件的導入工作完成。

 

 


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