使用bcftools提取指定樣本的vcf文件（extract specified samples in vcf format）
1、下載安裝bcftools。 2、准備樣本ID文件，這里命名為samplelistname.txt，一個樣本一行，如下所示： sample1 sample2 sample3 3、輸入命令： bcftools view -S samplelistname.txt ...
原文：bcftools或vcftools提取指定區段或者多個指定位置的vcf文件（extract specified position ）
bcftools提取指定區段的vcf文件 下載安裝bcftools 見如下命令： bcftools filter Genomes.vcf.gz regions : gt .vcf 注意：輸入的vcf以gz格式存在，不然會報錯：Failed to open Genomes.vcf: not compressed with bgzip 如何將vcf生成gz格式，見這篇文章bcftools將vcf生成 ...
2018-06-22 14:47 0 2803 推薦指數：
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