原文:用R的dgCMatrix包來構建稀疏矩陣 | sparse matrix by dgCMatrix

sparse matrix是用來存儲大型稀疏矩陣用得,單細胞表達數據基本都用這個格式來存儲,因為單細胞很大部分都是 ,用普通文本矩陣存儲太占空間。 使用也是相當簡單: library Matrix readsCount lt read.csv data count.csv , header T, row.names readsCountSM lt as as.matrix readsCount ...

2018-03-28 17:16 0 3450 推薦指數:

查看詳情

scipy.sparse 稀疏矩陣

from 博客園(華夏35度)http://www.cnblogs.com/zhangchaoyang 作者:Orisun 本文主要圍繞scipy中的稀疏矩陣展開,也會介紹幾種scipy之外的稀疏矩陣的存儲方式。 dok_matrix 繼承自dict,key是(row,col ...

Thu Nov 02 21:54:00 CST 2017 0 2459
R語言矩陣matrix函數

矩陣是元素布置成二維矩形布局的R對象。 它們包含相同原子類型的元素。盡管我們可以創建只包含字符或只邏輯值的矩陣,但是它們沒有多大用處。我們使用的是在數學計算中含有數字元素矩陣。 使用 matrix()函數創建一個矩陣。 語法 R語言中創建矩陣的基本語法是: matrix(data ...

Sun Aug 06 03:59:00 CST 2017 0 19767
Python 高維數組“稀疏矩陣”scipy sparse學習筆記

scipy 里面的sparse函數進行的矩陣存儲 可以節省內存 主要是scipy里面的 sparse 這里目前只用到兩個 稀疏矩陣的讀取 轉稀疏矩陣為普通矩陣 處理成為普通矩陣之后可以調用pd.DataFrame()轉化為數據框之后的操作就比較好 ...

Sun Jan 19 07:49:00 CST 2020 2 1112
 
粵ICP備18138465號   © 2018-2025 CODEPRJ.COM