質控工具之cutadapt的使用方法
cutadapt 參考：用cutadapt軟件來對雙端測序數據去除接頭 fastqc可以用於檢測，檢測出來了怎么辦？ 看了幾篇高水平文章，有不少再用cutadapt，雖然有時候數據真的不錯，但是還是要質控一下，修剪一下。 cutadapt -a ADAPTER_FWD ...
原文：質控工具之TrimGalore使用方法
TrimGalore 就是一個簡單的perl wrapper，打包了fastqc和cutadapt，但是卻非常實用。 因為cutadapt的參數選擇實在是有夠復雜，光接頭類型就有 種，還有各種參數，大哥，我就想去去接頭 trim一下質量而已，你就不能自動搞了嗎。不要給選擇困難症的我這么多選擇啊。 想自動化 trim galore 完美的符合了你的需求，無需自己去查接頭，全自動質量過濾，噢耶。 還能 ...
2018-03-27 13:26 0 2377 推薦指數：
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