目錄 一、研究內容 1.比較基因組分析 2. 核心基因/非必需基因分析 泛基因組大小模擬 核心基因/非必需基因功能富集 核心基因/非必需基因保守性分析 核心基因/非必需基因與重復序列相關性 ...
. 基因家族聚類 基因家族是來源於同一個祖先,由一個基因通過基因重復和物種分歧而產生兩個或更多的拷貝而構成的一組基因,它們在結構和功能上具有明顯的相似性,編碼相似的蛋白質產物,同一家族基因可以緊密排列在一起,形成一個基因簇,但多數時候,它們是分散在同一染色體的不同位置,或者存在於不同的染色體上的,各自具有不同的表達調控模式。基因家族的鑒定,是進化分析很重要的一個方面 OrthoMCL http: ...
2018-03-24 13:05 2 8163 推薦指數:
目錄 一、研究內容 1.比較基因組分析 2. 核心基因/非必需基因分析 泛基因組大小模擬 核心基因/非必需基因功能富集 核心基因/非必需基因保守性分析 核心基因/非必需基因與重復序列相關性 ...
第一代無創產前診斷是通過染色體倍數異常來判斷的,最典型的就是先抽取孕婦的外周血,提取游離DNA,通過高通量測序技術分析每染色體片段,判斷胎兒是否是21號三倍體。第二代無創產前診斷分析的是基因突變診斷。 最新這篇文章通過針對母體血漿DNA進行全基因組測序(195×和270×單倍體基因組覆蓋),探索 ...
宏基因組測序: 濃度>=50ng/ul OD260/280:1.8-2.0 DNA兩次需要量>=3ug 宏基因組測序需要提供什么樣品要求? (1)提供環境微生物的基因組DNA或者擴增產物,OD值在1.8 ...
出處:bilibili 關聯分析(Association):在交易數據、關系數據或其他信息載體中 ...
最近學習微生物宏基因組分箱(binning),按官方文檔安裝metaWRAP,踩了一堆坑,記錄一下報錯及解決方法: 1. metaWRAP安裝 安裝教程及下載地址:GitHub - bxlab/metaWRAP: MetaWRAP - a flexible pipeline ...
目錄 軟件的安裝 基因組的准備 一些細節 建議和示例 軟件的安裝 Python版McScan(jcvi工具包):https://github.com/tanghaibao/jcvi 以前只有python2,現在已有python3版本,建議用py3 ...
軟件簡介 MCScanX工具集對MCScan算法進行了調整,用於檢測共線性和同線性區域,還增加了可視化和下游分析。。MCscanX有三個核心工具,以及12個下游分析工具。 軟件安裝 進入官網http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/#tm,下載安裝 ...
前段時間有位小可愛問我,為什么她的QQ圖特別飄,如果你不理解怎樣算飄,請看下圖: 理想的QQ圖應該是這樣的: 我當時的第一反應是:1)群體分層造成的;2)表型分布有問題。因此讓她檢查一下數據 ...