前言 做RNA-seq基因表達數據分析挖掘，我們感興趣的其實是“基因互作”，哪些基因影響了我們這個基因G，我們的基因G又會去影響哪些基因，從而得到基因調控的機制。 直覺確實是很明確的，但是細節處卻有很多問題。 我們討論的到底是基因表達的互作，還是基因產物的互作 ...

打開Cytoscape軟件，根據菜單導入string_interactions.tsv文件 File ----> Import ----> Network from File 會彈出下圖對話框，在對話框中設置如下： 選中string_interactions.tsv文件，點擊 ...

igaph 是一個項目，目標是建立一條簡單，易用的網絡分析工具，有 R, python, C/C++ 等語言的具體實現； 項目主頁： http://igraph.org/ 在R語言中，對應的就是 igraph 這個R包 安裝： 使用： 對於圖 graph 這種 ...

R語言構建蛋白質網絡並實現GN算法 目錄 R語言構建蛋白質網絡並實現GN算法 1.蛋白質網絡的構建 2.生物網絡的模塊發現方法 3.模塊發現方法實現和圖形展示 1) 基於點連接的模塊發現 ...

d3network包 http://www.cnblogs.com/shangfr/p/5417054.html ShangFR 2016年5月6日 R d3network包 力導向圖 桑基圖(Sankeydiagram ...

d3network包 code{white-space: pre;} pre:not([class]) { background-color: white; } .main-container { max-width: 940px ...

目錄 1. 簡介 2. 近幾年發表的主要工具 1.DeepRT 2.Prosit 3. DIANN 4.DeepDIA 1. 簡介 基於串聯質譜的蛋白質組學大部分是依賴於數據庫（database search ...

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