原文:Deseq2 的可視化策略匯總

MA圖 對於MA圖而言, 橫坐標為該基因在所有樣本中的均值,basemean basemean A basemean B , 縱坐標為 log Fold change 其中,pvalue lt . 以下的點被認為是差異基因,標記為紅色 count 圖 單個基因在不同組樣本中的分布 為了防止樣本表達量相同時,點出現重合的情況,添加了擾動 library ggplot ggplot d, aes x ...

2018-02-22 11:21 0 3449 推薦指數:

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Error in library(DESeq2) : 不存在叫‘DESeq2’這個名字的程輯包

在安裝‘DESeq2’這個包的最后出現上面的錯誤。可以看出是‘Biobase’這個包有問題。重新安裝此包后,再一次安裝‘DESeq2’,安裝成功。 library('DESeq2')出現下面問題: 缺少GenomeInfoDb包,繼續安裝 ...

Wed Dec 06 22:44:00 CST 2017 1 7426
DESeq2 install --- 如何安裝R包("RcppArmadillo")?

安裝R包(“RcppArmadillo”)失敗,導致依賴該包的DESeq2 無法使用; 首先對gcc,g++升級至4.7, 但依然報錯,還是安裝不了RcppArmadillo; 報錯如下: $ R > source("https://bioconductor.org ...

Thu Feb 16 21:15:00 CST 2017 0 2410
web可視化圖形編輯器匯總

歡迎關注前端早茶,與廣東靚仔攜手共同進階 前端早茶專注前端,一起結伴同行,緊跟業界發展步伐~ 公眾號作者:廣東靚仔 前言: 有些時候,我們需要使用到可視化繪圖的編輯器。這里給大家收集了一些,如下所示。 正文: 1.mxgraph: 介紹:開源免費,但是需要 ...

Sat Mar 06 00:49:00 CST 2021 0 1341
簡單使用DESeq2/EdgeR做差異分析

簡單使用DESeq2/EdgeR做差異分析 Posted: 五月 07, 2017 Under: Transcriptomics By Kai no Comments DESeq2和EdgeR都可用於做基因差異表達分析,主要也是用於RNA-Seq數據,同樣也可以處理類似 ...

Sat Nov 10 05:33:00 CST 2018 0 4084
SQLite可視化管理工具匯總

搜集了一些SQLite工具,在這里做個總結,有的工具用的多一些,有的只是簡單試用,甚至未試用,所以有描述不當的還請回復指正,也歡迎補充完善! 2015-03-11 更新情況: SQLiteSpy最 ...

Fri Apr 14 01:01:00 CST 2017 0 5773
漂亮又好用的Redis可視化客戶端匯總

因為 Redis 官方只提供了命令行版的 Redis 客戶端 redis-cli,以至於我們在使用的時候會比較麻煩,通常要輸入一堆命令,而且命令行版的客戶端看起來也不夠直觀,基於以上兩個原因我們需要找一個可視化的 Redis 客戶端,下面是我這些年使用過的一些 Redis 可視化客戶端,分享 ...

Fri Jun 19 21:36:00 CST 2020 2 3749
數據可視化(二)

本文來源:https://www.dataquest.io/mission/132/data-visualization-and-exploration 本文數據來源https://github.c ...

Wed Mar 02 19:23:00 CST 2016 0 8939
 
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