PCA和PCoA
講解很詳細：http://blog.genesino.com/2016/10/PCA/ PCA分析一般流程： 中心化（centering， 均值中心化，或者中位數中心化），定標（scale，如果數據沒有定標，則原始數據中方差大的變量對主成分的貢獻會很大。） 根據前面的描述，原始變量 ...
原文：pca ， nmds , pcoa 圖添加分組的橢圓
對於pca , nmds, pcoa 這些排序分析來說，我們可以從圖中看出樣本的排列規則，比如分成了幾組。 為例樣本分組更加的直觀，我們可以根據實驗設計時的樣本分組情況，對屬於同一個group的樣本添加 個橢圓或者其他多邊形。 新版本的ggplot 中提供了stat ellipse 這個stat， 可以方便的實現上面的效果。 代碼示例： 效果圖如下： 通過stat ellipse 簡單有方便，其中 ...
2018-01-05 13:06 0 6172 推薦指數：
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