原文:關於 minor allele frequency(次等位基因頻率)的理解

引用自NCBI的概念 https: www.ncbi.nlm.nih.gov projects SNP docs rs attributes.html gmaf Global minor allele frequency MAF : dbSNP is reporting the minor allele frequency for each rs included in a default gl ...

2017-12-19 19:23 0 9522 推薦指數:

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plink, vcftool計算等位基因頻率allele frequency,vcf)

計算等位基因頻率有兩種方式,第一種用vcftool計算: /path/to/vcftools --vcf file.vcf --freq --chr 1 --out filefreq   很簡單的一個命令行,file.vcf指的是你要輸入的vcf文件,--freq表示計算等位基因 ...

Thu Sep 21 07:17:00 CST 2017 4 3573
關於Allele(等位基因)的理解

  高中學生物的時候關於遺傳學的部分,記得當時的教材上為了簡化處理一般將基因型定義為AA, Aa, aa。其實這種抽象的理解對應付高考是很有用的,但是實際應用中如果還這樣理解那么便會產生一些疑問。之所以會產生這樣的抽象,原因是早期並不知道雙螺旋DNA是遺傳物質,就更不提什么中心法則和DNA測序 ...

Tue Dec 19 23:46:00 CST 2017 0 5005
等位基因(biallelic sites )和多等位基因(multiallelic sites)

等位基因(biallelic sites ):表示在基因組的某個位點上有兩個等位基因,如下圖第七個位點所示,有G/-兩種形式: 多等位基因(multiallelic sites):表示在基因組的某個位點上存在有多個等位基因,如下圖第七個位點所示,在不同的樣本中,有G、C、T、-幾種形式: ...

Sat Oct 15 01:54:00 CST 2016 0 1590
兩對等位基因控制一對相對性狀的規律(基因互作)

兩對等位基因控制一對相對性狀的規律(基因互作) 參考文檔:https://wenku.baidu.com/view/edf42b6682c4bb4cf7ec4afe04a1b0717fd5b3e1.html?from=search 基因互作是指幾對等位基因之間通過相互作用影響同一性 ...

Mon Jul 29 01:17:00 CST 2019 0 2579
solr 統計頻率(term frequency

  1、統計單詞在某個字段出現的頻率次數     term frequency實現使用了function query.     例如統計‘公司’這個關鍵字在text這個字段中出現的次數    在返回的時候進行計算統計,即在返回參數fl中設置為fl=id,freq:termfreq(text ...

Tue Dec 12 19:22:00 CST 2017 0 1825
【種群歷史動態】評估方法SFS(Site/Allele Frequency Spectrum)

SFS解釋原文:joint SFS – The G-cat 參考博客:種群動態歷史評估方法之 SFS(Site/Allele Frequency Spectrum) - 簡書 (jianshu.com) 基因組數據統計可以總結數據集中等位基因的變異或分布,而無需我們所有樣品的整個基因序列 ...

Fri Apr 08 00:57:00 CST 2022 0 4068
 
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