計算等位基因頻率有兩種方式,第一種用vcftool計算: /path/to/vcftools --vcf file.vcf --freq --chr 1 --out filefreq 很簡單的一個命令行,file.vcf指的是你要輸入的vcf文件,--freq表示計算等位基因 ...
引用自NCBI的概念 https: www.ncbi.nlm.nih.gov projects SNP docs rs attributes.html gmaf Global minor allele frequency MAF : dbSNP is reporting the minor allele frequency for each rs included in a default gl ...
2017-12-19 19:23 0 9522 推薦指數:
計算等位基因頻率有兩種方式,第一種用vcftool計算: /path/to/vcftools --vcf file.vcf --freq --chr 1 --out filefreq 很簡單的一個命令行,file.vcf指的是你要輸入的vcf文件,--freq表示計算等位基因 ...
高中學生物的時候關於遺傳學的部分,記得當時的教材上為了簡化處理一般將基因型定義為AA, Aa, aa。其實這種抽象的理解對應付高考是很有用的,但是實際應用中如果還這樣理解那么便會產生一些疑問。之所以會產生這樣的抽象,原因是早期並不知道雙螺旋DNA是遺傳物質,就更不提什么中心法則和DNA測序 ...
的variant 參考人群等位基因頻率數據庫 基因變異耐受性 可以不做這方面的工作 ...
雙等位基因(biallelic sites ):表示在基因組的某個位點上有兩個等位基因,如下圖第七個位點所示,有G/-兩種形式: 多等位基因(multiallelic sites):表示在基因組的某個位點上存在有多個等位基因,如下圖第七個位點所示,在不同的樣本中,有G、C、T、-幾種形式: ...
兩對等位基因控制一對相對性狀的規律(基因互作) 參考文檔:https://wenku.baidu.com/view/edf42b6682c4bb4cf7ec4afe04a1b0717fd5b3e1.html?from=search 基因互作是指幾對等位基因之間通過相互作用影響同一性 ...
目錄 1. 主要參考文獻 1) 綜述 2)研究和方法 水稻PNAS——張啟發、刑鋒 棉花NC——胡冠菁、包穎 ...
1、統計單詞在某個字段出現的頻率次數 term frequency實現使用了function query. 例如統計‘公司’這個關鍵字在text這個字段中出現的次數 在返回的時候進行計算統計,即在返回參數fl中設置為fl=id,freq:termfreq(text ...
SFS解釋原文:joint SFS – The G-cat 參考博客:種群動態歷史評估方法之 SFS(Site/Allele Frequency Spectrum) - 簡書 (jianshu.com) 基因組數據統計可以總結數據集中等位基因的變異或分布,而無需我們所有樣品的整個基因序列 ...