軟件簡介 MCScanX工具集對MCScan算法進行了調整，用於檢測共線性和同線性區域，還增加了可視化和下游分析。。MCscanX有三個核心工具,以及12個下游分析工具。 軟件安裝 進入官網http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/#tm，下載安裝 ...

目錄 軟件的安裝 基因組的准備 一些細節 建議和示例 軟件的安裝 Python版McScan（jcvi工具包）：https://github.com/tanghaibao/jcvi 以前只有python2，現在已有python3版本，建議用py3 ...

共線性又稱同線性，是一個物種的基因組中相互連鎖的基因，在另一物種的基因組中也是連鎖關系， 而且在兩個物種的遺傳圖上的位置也是相同的 。 ...

本來是不會再寫這個文檔的，但是由於長時間沒有用這個模塊，這個模塊不知道是我自己弄掉了，還是別的同學誤刪了，於是我重新安裝一下。 首先下載conda，並下載好python which pip ...

目錄 腫瘤基因組分析 腫瘤標准分析 高級分析 腫瘤數據庫 腫瘤基因組分析 腫瘤進化過程 基本概念：germline/somatic/driver/passenger mutation 二次打擊學說：生殖突變+體細胞突變 主要 ...

檢驗多重共線 如果發現存在多重共線性，可以采取以下處理方法。 (1)如果不關心具體的回歸系數，而只關心整個方程預測被解釋變量的能力，則通常可以不必理會多重共線性（假設你的整個方程是顯著的）。這是因為，多重共線性的主要后果是使得對單個變量的貢獻估計不准，但所有變量的整體效應仍可以較准確 ...

出處：bilibili 關聯分析（Association）：在交易數據、關系數據或其他信息載體中 ...

宏基因組測序： 濃度>=50ng/ul OD260/280：1.8-2.0 DNA兩次需要量>=3ug 宏基因組測序需要提供什么樣品要求？ （1）提供環境微生物的基因組DNA或者擴增產物，OD值在1.8 ...