一:導入R包及需要畫熱圖的數據 library(pheatmap) data<- read.table("F:/R練習/R測試數據/heatmapdata.txt",head = T,row.names=1,sep="\t") 二:畫圖 1)pheatmap(data)#默認參數 ...
如何利用R包qqman畫曼哈頓圖 lili生信人 眾多周知,R語言提供了各種各樣的包,方便實現我們的目的,下面給大家介紹一個可以便捷的畫曼哈頓圖的包:qqman install.packages qqman 安裝包 library qqman 加載包 data package qqman 查看qqman包中的測試數據,此包中包含gwasResultssnpsOfInterest 兩個測試數據 V ...
2017-11-23 13:14 0 4976 推薦指數:
一:導入R包及需要畫熱圖的數據 library(pheatmap) data<- read.table("F:/R練習/R測試數據/heatmapdata.txt",head = T,row.names=1,sep="\t") 二:畫圖 1)pheatmap(data)#默認參數 ...
歡迎來到"bio生物信息"的世界 之前的推文GWAS: 曼哈頓圖,QQ plot 圖,膨脹系數( manhattan、Genomic Inflation Factor)寫過如何用qqman包做曼哈頓圖。 但眾所周知(據我說知),這個包畫圖很丑,尤其想highlight顯著位點時,屎一樣的綠色讓人 ...
d3network包 http://www.cnblogs.com/shangfr/p/5417054.html ShangFR 2016年5月6日 R d3network包 力導向圖 桑基圖(Sankeydiagram ...
d3network包 code{white-space: pre;} pre:not([class]) { background-color: white; } .main-container { max-width: 940px ...
1.用qplot(x,data=data,geom.=”bar”,weight=y)+scale_y_continuous("y")畫出y關於x的條形。 圖中提示binwidth這里是指 ...
qqman軟件包簡介 所述qqman包包括用於從GWAS結果創建曼哈頓地塊和qq函數作圖。gwasResults軟件包中包含的data.frame具有22個染色體上的16,470個SNP的模擬結果。看一下數據: 每個染色體上有幾個SNP? 創建曼哈頓圖 現在 ...
1.生存曲線 基礎包survival+擴展包survminer。 survival包內置肺癌數據集lung。 生存曲線進一步修飾。 其他類型生存曲線繪制。 fun參數默認pct (survival probability in percentage),即累計生存率,此外fun ...
一開始用lattice包,感覺在多元數據的可視化方面,確實做得非常好。各種函數,可以實現任何想要實現的展示。 barchart(y ~ x) y對x的直方圖 bwplot(y ~ x) 盒形圖 ...