pheatmap, gplots heatmap.2和ggplot2 geom_tile實現數據聚類和熱圖plot
主要步驟 pheatmap 數據處理成矩陣形式，給行名列名 用pheatmap畫熱圖（pheatmap函數內部用hclustfun 進行聚類） ggplot2 數據處理成矩陣形式，給行名列名 hclust聚類，改變矩陣行列順序為聚類后的順序 melt數據，處理 ...
原文：聚類熱圖
聚類：計算distance：dist data ,data必須是數字類型的，如果有字符串類型的必須去掉。否則會出現錯誤。 熱圖： 兩種方法：一是ggplot 自帶的geom tile 二是pheatmap包。 一，使用geom tile ，需要自己聚類數據。 二，使用pheatmap包，設置參數即可聚類數據。 ...
2018-07-03 16:38 0 808 推薦指數：
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