關於 minor allele frequency（次等位基因頻率）的理解
引用自NCBI的概念（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/docs/rs_attributes.html#gmaf） Global minor allele frequency (MAF): dbSNP is reporting ...
原文：plink, vcftool計算等位基因頻率（allele frequency，vcf）
計算等位基因頻率有兩種方式，第一種用vcftool計算： path to vcftools vcf file.vcf freq chr out filefreq 很簡單的一個命令行，file.vcf指的是你要輸入的vcf文件， freq表示計算等位基因頻率， chr后面的 表示你要計算的區域在 號染色體，當然，你也可以選擇你想計算的染色體區域，filefreq指的是輸出的文件名。 結果如下圖所示： ...
2017-09-20 23:17 4 3573 推薦指數：
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