箱線圖 箱形圖(Box-plot)又稱為盒須圖、盒式圖或箱線圖,是一種用作 顯示一組數據分散情況資料的統計圖。因形狀如箱子而得名。在宏基因組領域,常用於展示樣品組中各樣品Alpha多樣性的分布 第一種情況,最大或最小值沒有超過1.5倍箱體 ...
繪制Alpha多樣性線箱圖 繪圖和統計全部為R語言,建議復制代碼,在Rstuido中運行,並設置工作目錄為存儲之前分析結果文件的result目錄 運行前,請在Rstudio中菜單欄選擇 Session Set work directory Choose directory ,彈窗選擇之前分析目錄中的result文件夾 安裝相關軟件包,如果末安裝改為TRUE運行即可安裝 if FALSE sour ...
2017-08-23 21:54 0 1260 推薦指數:
箱線圖 箱形圖(Box-plot)又稱為盒須圖、盒式圖或箱線圖,是一種用作 顯示一組數據分散情況資料的統計圖。因形狀如箱子而得名。在宏基因組領域,常用於展示樣品組中各樣品Alpha多樣性的分布 第一種情況,最大或最小值沒有超過1.5倍箱體 ...
散點圖 數據點在直角坐標系平面上的分布圖。在宏基因組領域,散點圖常用於展示樣品組間的Beta多樣性,常用的分析方法有主成分分析(PCA),主坐標軸分析(PCoA/MDS)和限制條件的主坐標軸分析(CPCoA/CCA/RDA)。 Beta ...
)或物種組成的差異(數據集內物種組成的異質性的非定向過程)。 下圖展示了Alpha多樣性、Beta多樣性和 ...
來自於:Joseph A. Konstan & John Riedl 推薦系統還有另外兩大特點,也對你最終看到的推薦結果有着顯著的影響:第一,在弄清楚你和其他購物者的相似度有多高之前 ...
本節課程,需要先完成 擴增子分析解讀1質控 實驗設計 雙端序列合並 2提取barcode 質控及樣品拆分 切除擴增引物 3格式轉換 去冗余 聚類 先看一下擴增子分析的整體流程,從下向上逐層分析 分析前准備 ...
QIIME2是微生物組分析流程QIIME(截止17.7.13被引7771次)的全新版(不是升級版),采用python3全新編寫,並於2018年1月全面接檔QIIME,是代表末來的分析方法標准(大牛 ...
# 激活工作環境 source activate qiime2-2017.8 # 建立工作目錄 mkdir -p qiime2-importing-tutorial cd qiime2-imp ...
本節課程,需要先完成《擴增子分析解讀》系列之前的操作 1質控 實驗設計 雙端序列合並 2提取barcode 質控及樣品拆分 切除擴增引物 3格式轉換 去冗余 聚類 4去嵌合體 非細菌序列 生成代表性序列和OTU表 分析前准備 ...