擴增子分析解讀1質控 實驗設計 雙端序列合並
本文采用目前最主流的擴增子測序數據類型HiSeq2500 PE250類型數據為例，結合目前主流方法QIIME+USearch定制的分析流程。本課程中所需的測序數據、實驗設計和課程分析生成的中間文件，均可以直去百度雲下載。鏈接：http://pan.baidu.com/s/1hs1PXcw 密碼 ...
原文：擴增子分析解讀2提取barcode 質控及樣品拆分 切除擴增引物
本節課程，需要完成 擴增子分析解讀 質控 實驗設計 雙端序列合並 先看一下擴增子分析的整體流程，從下向上逐層分析 分析前准備 進入工作目錄 cd example PE 上一節回顧：我們拿到了雙端數據，進行了質控 並對實驗設計進行了填寫和檢查 最后將雙端數據合並為單個文件進行下游分析。 接下來我們將序列末端的barcode標簽切下來，因為它們是人為添加的，不屬於實驗對象 再根據標簽序列與實驗設計文 ...
2017-08-21 06:27 0 1798 推薦指數：
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