GTF文件的全稱是gene transfer format，主要是對染色體上的基因進行標注。怎么理解呢，其實所謂的基因名，基因座等，都只是后來人們給一段DNA序列起的名字而已，還原到細胞中就是細胞核里面的一條長長的染色體（DNA序列）。而這個GTF文件的主要功能，就是指出我們所謂的基因在染色體 ...

轉自：https://blog.csdn.net/sinat_38163598/article/details/72851239 1.基本 GFF和GTF是兩種最常用的數據庫注釋格式，基因注釋文件。 GFF全稱為general feature format，這種格式主要是用來注釋基因組 ...

我們在做生物分析的時候，經常會碰到GFF格式的文件以及GTF格式的注釋文件。他們有着相似的名字，甚至連內容都極為相似~那么，他們究竟差在哪里呢？ GFF全稱為general feature format，這種格式主要是用來注釋基因組。 GTF全稱為gene transfer ...

工具推薦：https://github.com/openvax/gtfparse 真不敢相信，Linux自帶的命令會這么強大，從gtf中提取出需要的transcript，看起來復雜，其實一個grep就搞定了。 grep -F -f out.list gffcmp.combined.gtf ...

hg19有哪些染色體？ chr1 chr2 chr3 chr4 chr5 chr6 chr7 chr8 chr9 chr10 chr11 chr12 chr13 chr14 chr15 chr ...

我們生信技能書有一篇介紹bedtools的文章，可以在微信里搜着看下，非常有用。 bedtools 用法大全 http://bedtools.readthedocs.io/en/latest/ gtf轉bed用Linux命令完全可以實現，因為gtf每一行比較規律，不像fasta和fastq ...

1）gff3及gtf2簡介 一個物種的基因組測序完成后，需要對這些數據進行解讀，首先要先找到這些序列中轉錄起始位點、基因、外顯子、內含子等組成元件在染色體中的位置信息(即注釋)后才能再進行深入的分析。gff/gtf是貯存這些注釋信息的兩種文件格式。 GFF(general feature ...

1 - 什么是構建？ 我們都知道，寫完代碼之后需要進行編譯和運行，以筆者自身為例，使用 Eclipse 寫完代碼，需要進行編譯，再生成 war 包，以便部署到 Tomcat。 　　 ...