根據bed文件從fasta文件中獲取基因序列
第一次寫博客，分享一個做的提取基因序列的程序，根據bed文件里的位置信息從基因組里提取序列 源碼地址：https://github.com/Liuyuan2018/fastaTools/blob/master/pyGetFasta.py bed文件通常用來保存注釋基因信息，BED文件必須的3列 ...
原文：fasta文件中序列的排序
同樣的名為read .fa 的fasta文件，里面有若干序列，如： gt r TGAATGCGAACTCCGGGACGCTCAGTAATGTGACGATAGCTGAAAACTGTACGATAAACNGTACGCTGAGGGCAGAAAAAATCGTCGGGGACATTNTAAAGGCGGCGAGCGCGGCTTTTCCG gt r NTTNTGATGCGGGCTTGTGGAGTTCAGCCGATC ...
2017-05-17 22:03 0 1322 推薦指數：
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注：該腳本適用於序列不斷開的情況 可用一下命令將折行的序列合並為一行 運行腳本 升級版，輸入文件是 fasta 格式即可。用 Bio 中的 Seq.IO 解析 fasta 文件， 用 python 的內置函數 count() 的計算速度更快。 ...
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