基因組注釋
基因組注釋主要包括四個研究方向：重復序列的識別；非編碼RNA的預測；基因結構預測和基因功能注釋。我們將分別對這四個領域進行闡述。 1 重復序列的識別。 1.1 重復序列的研究背景和意義：重復序列可分為串聯重復序列（Tendam repeat）和散在重復序列 ...
原文：R語言實現對基因組SNV進行注釋
很多時候，我們需要對取出的SNV進行注釋，這個時候可能會在R上進行注釋，通常注釋文件都含有Chr 染色體 Start 開始位點 End 結束位點 Description 描述 ，而我們的SNV文件通常是擁有Position 位置 ，因此我們可以先定位Chr，再用Postion去定位到Start和End之間，找到相對應的Description。為了加快速度，可以使用二分查找法。 在R中使用for循 ...
2017-04-07 20:50 0 1566 推薦指數：
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