fastx_toolkit軟件使用說明
高通量測序數據下機后的原始fastq文件，包含4行，其中一行為質量值，另外一行則為對應序列，我們都了解高通量的數據處理首先要進行質量控制，這些過程包括去接頭、過濾低質量reads、去除低質量的3’和5’端，去除N較多的reads等，而針對高通量測序數據的質控軟件也有很多，在這里給大家介紹一款“老牌 ...
原文：fastx_toolkit去除測序數據中的接頭和低質量的reads
高通量測序數據下機后得到了fastq的raw data，通常測序公司在將數據返還給客戶之前會做 clean 處理，即得到clean data。然而，這些clean data是否真的 clean 呢 首先，我們應該做一下質控。如果質控不合格，就需要一些處理，比如去接頭 去除量的reads。 去除測序數據中的接頭 用到的是fastx toolkit里面的fastx clipper工具 ： Usage: ...
2016-12-08 20:22 0 3025 推薦指數：
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