pysam - 多種格式基因組數據（sam/bam/vcf/bcf/cram/…）讀寫與處理模塊（python）
在開發基因組相關流程或工具時，經常需要讀取、處理和創建bam、vcf、bcf文件。目前已經有一些主流的處理此類格式文件的工具，如samtools、picard、vcftools、bcftools，但此類工具集成的大多是標准功能，在編程時如果直接調用的話往往顯得不夠靈活。 本文介紹的是一個處理 ...
原文：Jbrowse安裝和序列、bam、vcf配置
最近做了一個關於基因開發的項目，要求最終輸出的文件可以在專門的基因瀏覽器上邊顯示，類似統計圖的東西。廢話不說上圖 表示表達不出來 . 先說下Jbrowse這個東西吧，一句話：一個簡單的，便攜式依靠javascript的基因組瀏覽器。沒用過覺得挺高大上的，難度挺高。實際上用過之后覺得也就是那回事，沒多少難度，很容易上手。因為我是在虛擬機上邊訪問，用的是linux系統，所以這里我以linux為版本簡 ...
2016-11-24 10:22 0 1825 推薦指數：
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