【生物信息】RPKM, FPKM和TPM
注：這幾個名詞是RNA-Seq數據分析中的基礎，在此小結一下。 在RNA-Seq的分析中，對基因或轉錄本的read counts數目進行標准化（normalization）是一個極其重要的步驟 ...
原文：生物信息 perl 腳本實戰
索引 .統計fasta fa和fastq文件的長度，統計fastq的reads個數，單個reads長度，reads總長度 統計fasta文件中contig的個數，列出名稱，單條的長度，以及總長度。 . 局部組裝：創建目錄，將比對好的reads按 k為單位，用samtools切，並用awk工具提起reads，分別存放在對應文件夾內 . 局部組裝：用得到的reads name，去原始的下機reads里 ...
2016-08-11 16:17 0 3716 推薦指數：
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