1、下載fastqc wget http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.5.zip 2、解壓 unzip fastqc ...
安裝 FastQC FastQC 下載 解壓 設置權限 加入到 PATH 測試 應該能看到幫助信息,說明已經安裝成功 ...
2015-09-24 13:23 0 3309 推薦指數:
1、下載fastqc wget http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.5.zip 2、解壓 unzip fastqc ...
1.從官網下載FastQC https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/ 2.解壓文件,並進入該文件 將其至於某個文件夾,unzip fastqc_v0.11.5.zip. 3.進入解壓目錄,設置可執行權限 ...
由於之前的HPC太難用了,所以決定搬家到十樓的工作站,於是就免不了配置必要的工作環境,其中一個少不了要安裝的軟件是就是fastqc,因為它太常用了。 我先是用conda安裝,因為conda實在是太方便了,於是命令行:conda install fastqc 后面一路yes下去搞定,果然很順 ...
1.fastqc是在Java環境下運行的;所以在安裝fastqc之前,Linux下要有相應的Java運行環境(JRE).且java的版本應該在1.8.0版以上 2.java的安裝:下載最新版本的Java,注意要下載帶有JRE的版本。 3.解壓:tar -zxvf java.tar.gz ...
REF https://www.plob.org/article/5987.html 解壓后,查看html格式的結果報告。結果分為如下幾項: 結果分為綠色的"PASS",黃色的"WARN"和 ...
用FastQC檢查二代測序原始數據的質量 2013-01-28 21:28:10| 分類: Bioinformatics | 標簽:bioinformatics deep-seq |舉報 |字號大中小 訂閱 ...
先用conda安裝 很順利 輸入 結果 可是輸入 這個網上說沒有圖形界面 可以這樣 或者 都可以 ...
FastQC FastQC 是一個基於Java寫的測序數據質量評估軟件。因為是用跨平台的語言Java寫的,自然而然FastQC應是可以在不同系統運行的了。不過也許大多時候我們還是在Linux服務器上用的多吧。 安裝 安裝軟件,方便的還是通過conda了,一行命令: 當然這需要你已經安裝 ...