原文:[bio] STAR 通用超快的RNA aligner

rnacallvarients時gatk推薦工具,broad institute都推薦了,還是encode計划時冷泉港內部開發的,特點:超級快速 minmap完 gb的reads as支持性好 支持長reads 全轉錄本 發現嵌合轉錄本等,有理由看一下。百度了下,沒中文的博文,我來翻譯一個吧 原理: STAR utilizes sequential maximum mappable seed se ...

2014-10-03 11:27 0 2582 推薦指數:

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通用塊層bio詳解

Linux Block 層在 Linux 內核設計之初就作為幾大子系統存在,當然這也是得益於他的前輩 Unix 等優秀的設計。作為 IO 子系統的中間層,他為上層輸出接口,為下層提供數據,像個勤勞的小蜜蜂,本文介紹通用塊層中的最具傳奇色彩的 bio,他就像是一個原子,是在整個 block 層的最小 ...

Tue Dec 03 18:32:00 CST 2019 0 480
微人事 star 10k,如何打造一個 star 10k 的開源項目

看了下,微人事(https://github.com/lenve/vhr)項目 star 10k 啦,松哥第一個 star 數過萬的開源項目就這樣誕生了。 兩年前差不多就是現在這個時候,松哥所在的公司業績下滑嚴重,關門倒閉已成定局,很多同事在謀划的新的出路,松哥則被公司留下來善后 ...

Tue Oct 15 18:46:00 CST 2019 1 1339
montreal-forced-aligner

下載: https://github.com/MontrealCorpusTools/Montreal-Forced-Aligner/releases/tag/v1.0.1 然后,解壓tar -zxvf montreal-forced-aligner ...

Sun Apr 04 09:51:00 CST 2021 0 431
RNA velocity | RNA速率

單細胞轉錄組確實是利器,但我們大多只利用了表達的信息,而從reads到表達之間的信息完全被我們忽略了。 最近nature發了一篇單細胞方法類文章,講得就是如何利用RNA velocity來做細胞發育路徑的推斷。 velocyto velocyto-notebooks RNA ...

Mon Aug 20 20:19:00 CST 2018 0 2390
2021 github java領域40k star項目,top10 拿走,不謝

2021 github java領域40k star項目,top10 拿走,不謝 原創2021-07-24 00:23·undergrowth CyC2018/CS-Notes 技術面試的必備知識,官方網站----http://www.cyc2018.xyz/,主要是涉及計算機 ...

Wed Jul 28 17:36:00 CST 2021 0 161
Forest v1.5.13 發布,聲明式 HTTP 框架,已 1.7k star

Forest介紹 Forest 是一個開源的 Java HTTP 客戶端框架,它能夠將 HTTP 的所有請求信息(包括 URL、Header 以及 Body 等信息)綁定到您自定義的 Interface 方法上,能夠通過調用本地接口方法的方式發送 HTTP 請求 現已超過 1700 star ...

Tue Nov 16 23:28:00 CST 2021 0 320
 
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