bam/sam格式說明
在SAM輸出的結果中每一行都包括十二項通過Tab分隔（\t），從左到右分別是： 1 QNAME,序列的名字（Read的名字） 2 FLAG, 概括出一個合適的標記，各個數字分別代表 1 序列是一對序列中的一個 2 比對結果是一個pair-end比對的末端 ...
原文：SAM格式
SAM是一種序列比對格式標准， 由sanger制定，是以TAB為分割符的文本格式。主要應用於測序序列mapping到基因組上的結果表示，當然也可以表示任意的多重比對結果。 不同的軟件，不同的時期，不同的研究方向，都會創建一種或者多種格式標准，當然根據當時的需要，創建符合需求的標准，也是最容易的事情，而反過來想要真正的理解標准，也必須理解為什么要創建這樣的標准，解決什么樣的需要。我前面的有篇文章已經 ...
2012-10-25 10:13 1 8140 推薦指數：
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bam/sam 文件格式詳解
sam/bam 是一種序列比對格式標准，由sanger制定，是以TAB為分割符的文本格式。主要應用於測序序列mapping到基因組上的結果表示，當然也可以表示任意的多重比對結果。通常是把FASTQ文件格式的測序數據比對到對應的參考基因組版本得到的。 header 部分 sam 分為兩部分，注釋 ...
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文件格式如是下圖這種格式： 那么就可以通過通過kali終端samdump2 + system + sam 生成出來通過hashcat -m 1000去跑，或者通過md5查詢 ...
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SAM格式 及 比對工具之 samtools 使用方法
參考資料: SAMtools（官網） SAM Spec v1.4 （SAM格式 說明書） （重要） samtools-1.3.1 使用手冊 （SAMtools軟件說明書） samtools常用命令詳解(博客園) SAM格式定義（博耘生物） samtools使用方法 ...